本发明公开了一种控制半矮秆多分蘖性状的基因Hvhtd，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所述。本发明还同时提供了上述半矮秆多分蘖基因Hvhtd编码的蛋白质，所述蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO：3所述。本发明还同时提供了基于内含子2的鉴定大麦半矮秆多分蘖基因Hvhtd的分子标记SNP62；本发明所获得的分子标记SNP62，可以鉴定大麦中是否含有Hvhtd半矮秆多分蘖基因。本发明利用该标记进行Hvhtd基因的半矮秆多分蘖育种辅助选择可以保证100％的准确率，加快大麦半矮秆多分蘖育种进度。
本发明公开了一种控制半矮秆多分蘖性状的基因fol‑a，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所述。本发明还同时公开了上述半矮秆多分蘖基因fol‑a编码的蛋白质，所述蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO：3所述。本发明还同时公开了基于内含子3的鉴定大麦半矮秆多分蘖基因fol‑a的分子标记SNPE3。利用分子标记SNPE3，可以鉴定大麦中是否含有fol‑a半矮秆多分蘖基因。利用该标记进行fol‑a基因的半矮秆多分蘖育种辅助选择可以保证100％的准确率，加快大麦半矮秆多分蘖育种进度。
本发明公开了一种早熟基因eam.z及其分子标记SNP595和应用，由野生型大麦基因HORVU3Hr1G114970编码区595bp处的碱基由A变为T得到，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；本发明还提供了基于eam.z基因突变位点的分子标记SNP595，选自SEQ ID NO.5～7所示的引物对。利用该标记进行eam.z基因的早熟育种辅助选择可以保证100％的准确率，加快大麦早熟育种进度。
