[发明专利]检测样品中基因毒性化合物的诊断系统和方法有效
| 申请号: | 99800549.5 | 申请日: | 1999-04-12 |
| 公开(公告)号: | CN1263561A | 公开(公告)日: | 2000-08-16 |
| 发明(设计)人: | D·范德勒里;L·A·L·J·B·雷尼尔斯;S·塔割哈威;P·G·G·科比斯尔;L·P·E.威萨维 | 申请(专利权)人: | 佛兰芒技术研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02 |
| 代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 樊卫民 |
| 地址: | 比利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 样品 基因 毒性 化合物 诊断 系统 方法 | ||
1.一种诊断系统,包括:
--一种接触环境胁迫物质便可增加报道基因活性的转化微生物,所述微生物含应激可诱导型启动子序列,启动子序列与编码报道基因的核酸序列有效连接,该核酸序列编码一种产生可供检测的信号的报道分子,以及
--一种含组成型和非应激诱导型启动子序列的转化微生物,启动子序列与编码报道基因的核酸序列有效连接,该核酸序列编码一种产生可供检测的信号的报道分子。
2.根据权利要求1的系统,其中的信号以光产生和/或比色改变来测定。
3.根据权利要求1或2的系统,其中转化的生物发光微生物是大肠杆菌。
4.根据权利要求1或2的系统,其中转化的生物发光微生物是鼠伤寒沙门氏菌,优选地为适用于埃姆斯测验法的微生物,它有利地选自TA98、TA100、TA102、TA104、TA1535、TA1538、TA7001到TA7006和TA7041到TA7046,和/或保藏号为LMG P-18318的微生物。
5.根据前面的权利要求1-4中任一项的系统,其中的应激可诱导型启动子序列选自groEL、dnaK、grpE、phoA、glnA、lon、lysU、rpoD、clpB、clpP、uspA、katG、uvrA、frdA、micF、fabA、lac、his、sodA、sodB、Soi-28、recA、xthA、narG、recF、recJ、recN、recO、recQ、ruv、uvrD、ars、cad、mer、pco和sfiA。
6.根据前面权利要求1到5项中任一项的系统,其中组成型和非应激诱导型启动子序列是一段具有Sigma 70共有序列(TTGACA(-35)---17/18bp---TATAAT(-10)的序列,且其转录不受启动子水平的正负调控。
7.根据前面要求1到6项中任一项的系统,其中编码报道基因的核酸序列包含萤光素酶A和B基因或LuxAB翻译融合基因。
8.根据前面权利要求1到7项中任一项的系统,其中编码报道基因的核酸序列包含萤光素酶A和B基因,以及萤光素酶C、D和E基因,这些基因是产生用于循环的有限脂肪酸底物所必需的。
9.根据前面权利要求1到8项中任一项的系统,其中环境胁迫物质是存在于样品中的基因毒性和/或毒性化合物。
10.诊断试剂盒,其包含根据前面1到9项中任一项诊断系统中的各种元件,以及可能的话,还有所需的附加反应剂、稀释剂和/或固体支持物。
11.诊断环境胁迫物质的方法,优选地用于检测样品中基因毒性和/或毒性化合物的存在,包含的步骤:
-将根据前面1-8项中任一项的诊断系统与环境胁迫物质接触,且
-测量所述诊断系统中转化的生物发光微生物的信号。
12.用于测定样品中化合物的基因毒性动力学的方法,其中在多个时间点,优选为连续地测定诱导型和组成型的两种转化微生物发出的光,此外,进行测定此时间点转化微生物的信噪比(S/N)的步骤,以诱导型微生物的S/N比除以组成型微生物的S/N比,然后将这些数据绘图,所述图代表样品中基因毒性化合物的经校正的基因毒性动力学。
13.环境胁迫物质的分析方法,包括步骤:
-按权利要求11所述进行环境胁迫物质的诊断,
-计算两种转化微生物的信噪比,
-如果计算出的信噪比至少有一个低于0.8,将此环境胁迫物质归类为有毒的,
-如果含应激诱导型启动子序列的微生物之信噪比在0.8到1.2之间,则将此环境胁迫物归类为无影响,且
-如果含应激诱导型启动子序列的微生物的信噪比高于1.2,且比含组成型启动子序列的微生物之信噪比至少高50%时,将此环境胁迫物归类为具有诱导性和基因毒性。
14.检测样品中化合物是否具有基因毒性和/或毒性的设备,包括可由样品诱导的如权利要求1到9中任一项的诊断系统;还包括带有检测装置(2)的检测系统,其可以测定来自所述诊断系统中的信号,所述检测系统与计算机(1)相连,该计算机经编程按照前面权利要求11到13中任一项的方法进行分析。
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