[发明专利]豹纹鳃棘鲈抗神经坏死病毒性状相关的SNP位点及其应用有效
| 申请号： | 202310760826.7 | 申请日： | 2023-06-27 |
| 公开（公告）号： | CN116516028B | 公开（公告）日： | 2023-09-15 |
| 发明（设计）人： | 胡景杰;汪波;王靖雯;韦存;郭一兰;丁晖;王梦娅;吴绍轩;包振民 | 申请（专利权）人： | 中国海洋大学三亚海洋研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人： | 王美燕 |
| 地址： | 572024 海南省三亚*** | 国省代码： | 海南;46 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 豹纹 鳃棘鲈抗 神经 坏死 病毒 性状 相关 snp 及其 应用 | ||
1.检测豹纹鳃棘鲈抗神经坏死病毒性状相关的SNP位点的引物在豹纹鳃棘鲈抗病品种选育中的应用，所述抗病品种为抗神经坏死病毒品种，所述SNP位点包括6个SNP位点，其特征在于：
第1 SNP位点位于SEQ ID NO .1所示序列的第301位，其中第301位的碱基y是c或t；
第2 SNP位点位于SEQ ID NO .2所示序列的第300位，其中第300位的碱基r是a或g；
第3 SNP位点位于SEQ ID NO .3所示序列的第300位，其中第300位的碱基y是c或t；
第4 SNP位点位于SEQ ID NO .4所示序列的第301位，其中第301位的碱基y是c或t；
第5 SNP位点位于SEQ ID NO .5所示序列的第301位，其中第301位的碱基k是t或g；
第6 SNP位点位于SEQ ID NO .6所示序列的第301位，其中第301位的碱基s是c或g；
当样本第1 SNP位点的基因型为TT，第2 SNP位点的基因型为AG，第3 SNP位点的基因型为TC，第4 SNP位点的基因型为CC，第5 SNP位点的基因型为GG或第6 SNP位点的基因型为CG时，该样本感染神经坏死病毒后的存活率高于死亡率。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，
用于检测第1 SNP位点的上游引物序列如SEQ ID NO.7所示，下游引物序列如SEQ IDNO.8所示；
用于检测第2 SNP位点的上游引物序列如SEQ ID NO.9所示，下游引物序列如SEQ IDNO.10所示；
用于检测第3 SNP位点的上游引物序列如SEQ ID NO.11所示，下游引物序列如SEQ IDNO.12所示；
用于检测第4 SNP位点的上游引物序列如SEQ ID NO.13所示，下游引物序列如SEQ IDNO.14所示；
用于检测第5 SNP位点的上游引物序列如SEQ ID NO.15所示，下游引物序列如SEQ IDNO.16所示；
用于检测第6 SNP位点的上游引物序列如SEQ ID NO.17所示，下游引物序列如SEQ IDNO.18所示。
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