[发明专利]轻量级微卫星不稳定性检测装置及其应用在审
申请号: | 202310660707.4 | 申请日: | 2023-06-06 |
公开(公告)号: | CN116411084A | 公开(公告)日: | 2023-07-11 |
发明(设计)人: | 张腾龙;王冬冬;蔡丽丽;陈慧娟;商宇红;李建基 | 申请(专利权)人: | 北京求臻医疗器械有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 张柳 |
地址: | 100176 北京市大兴区北京经*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 轻量级 卫星 不稳定性 检测 装置 及其 应用 | ||
1.引物组,其特征在于,其包括:
(Ⅰ)、上游引物具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列;和
(Ⅱ)、下游引物具有如SEQ ID No.2所示的核苷酸序列。
2.标签引物组,其特征在于,其包括:
(Ⅰ)、Indexing Primer_I5具有如SEQ ID No.3所示的核苷酸序列;和
(Ⅱ)、Indexing Primer_I7具有如SEQ ID No.4所示的核苷酸序列;。
3.如权利要求2所述的标签引物组,其特征在于,所述标签引物组包括如下任意项:
(Ⅰ)、Indexing Primer_I5具有如SEQ ID No.101~196任意所示的核苷酸序列;和
(Ⅱ)、Indexing Primer_I7具有如SEQ ID No.5~100任意所示的核苷酸序列。
4.如下任意项在制备检测肿瘤试剂和/或试剂盒中的应用:
(Ⅰ)、如权利要求1所述的引物组;和/或
(Ⅱ)、如权利要求2或3所述的标签引物组;
所述肿瘤包括但不限于结直肠癌和/或子宫内膜癌;
所述检测根据MSI Score判断:MSI Score≥20%,判断为MSI-H;10%≤所述MSI Socore20%,判断为MSI-L;所述MSI Score10%,判断为MSS。
5.试剂和/或试剂盒,其特征在于,包括如下任意项以及可接受的助剂或载体:
(Ⅰ)、如权利要求1所述的引物组;和/或
(Ⅱ)、如权利要求2或3所述的标签引物组。
6.如下任意项在制备微卫星不稳定性检测装置中的应用:
(Ⅰ)、如权利要求1所述的引物组;和/或
(Ⅱ)、如权利要求2或3所述的标签引物组;和/或
(Ⅲ)、如权利要求5所述的试剂和/或试剂盒;
所述微卫星不稳定性检测的判断标准包括:MSI Score≥20%,判断为MSI-H;10%≤所述MSI Socore20%,判断为MSI-L;所述MSI Score10%,判断为MSS。
7.微卫星不稳定性检测装置,其特征在于,其包括如下任意项:
(Ⅰ)、如权利要求1所述的引物组;和/或
(Ⅱ)、如权利要求2或3所述的标签引物组;和/或
(Ⅲ)、如权利要求5所述的试剂和/或试剂盒。
8.如权利要求7所述的微卫星不稳定性检测装置,其特征在于,还包括高通量测序文库、MSI状态评价模块;
所述高通量测序文库采用如权利要求1所述的引物组、如权利要求2或3所述的标签引物组或如权利要求5所述的试剂和/或试剂盒PCR扩增构建;
所述MSI状态根据MSI Score判断:所述MSI Score≥20%,判断为MSI-H;10%≤所述MSISocore20%,判断为MSI-L;所述MSI Score10%,判断为MSS。
9.扩增方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤1:获得临床样本核酸;
步骤2:采用如权利要求1所述的引物组、如权利要求2或3所述的标签引物组或如权利要求5所述的试剂和/或试剂盒扩增。
10.微卫星不稳定性检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤1:获得临床样本核酸;
步骤2:采用如权利要求1所述的引物组、如权利要求2或3所述的标签引物组或如权利要求5所述的试剂和/或试剂盒PCR扩增,构建高通量测序文库,测序,收集数据;
步骤3:对所述数据进行分析,根据MSI Score判断MSI状态;
所述MSI Score≥20%,判断为MSI-H;10%≤所述MSI Socore20%,判断为MSI-L;所述MSI Score10%,判断为MSS。
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