[发明专利]长林小蠹SS-COI PCR检测引物以及检测方法在审
申请号: | 202310650254.7 | 申请日: | 2023-06-02 |
公开(公告)号: | CN116656835A | 公开(公告)日: | 2023-08-29 |
发明(设计)人: | 姚艳霞;李承锦;黄谊青;林若竹;淮稳霞;王小艺;赵文霞 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心) |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;C12Q1/686 |
代理公司: | 北京思元知识产权代理事务所(普通合伙) 11598 | 代理人: | 余光军;霍雪梅 |
地址: | 100091 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 长林小蠹 ss coi pcr 检测 引物 以及 方法 | ||
本发明公开了长林小蠹SS‑COI PCR检测引物以及检测方法。本发明根据长林小蠹完整COI序列中与近缘种差异较大的部分获得了特异性引物对,其核苷酸序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示。在此基础上,本发明提供了长林小蠹SS‑COI PCR检测方法以及长林小蠹SS‑COI PCR检测试剂盒,特异性检测结果表明,本发明建立的检测方法具有良好的特异性,能够特异性扩增长林小蠹,对于长林小蠹的近缘种均不能扩增,适用于长林小蠹的快速精准检测;灵敏度检测结果表明,本发明提供的长林小蠹SS‑COI PCR检测方法检测灵敏度高,检测限位DNA浓度为8.7×10supgt;‑2/supgt;ng/μL。
技术领域
本发明涉及昆虫PCR检测引物以及检测方法,尤其涉及长林小蠹SS-COI PCR检测引物以及检测方法,属于长林小蠹分子检测领域。
背景技术
长林小蠹(Hylurgus ligniperda Fabricius)(鞘翅目Coleoptera:象甲科Curculionidae)是中国新入侵的重要害虫,在山东省泰安市、烟台市、青岛市和威海市成功定殖且造成严重危害。长林小蠹在外部形态特征方面与华山松大小蠹、云杉大小蠹、纵坑切稍小蠹等种类十分相似,需要专业的昆虫分类学家进行种类识别与鉴定,难以满足口岸、海关及林业一线人员开展检疫工作的实际需求,十分不利于外来入侵种检疫管理及应急处置,亟需研发长林小蠹快速精准检测识别技术,以实现外来入侵种早期识别的重要目标,这对防止外来种侵害和生物安全起着十分重要的作用。
在采用PCR技术进行长林小蠹检测时,需要筛选得到高特异性和高灵敏度的PCR引物,才能实现长林小蠹快速、精准检测和识别。
发明内容
本发明的目的之一是提供长林小蠹SS-COI PCR检测引物;
本发明的目的之二是提供一种长林小蠹SS-COI PCR检测方法;
本发明的目的之三是提供一种长林小蠹SS-COI PCR检测试剂盒。
本发明的上述目的是通过以下技术方案来实现的:
本发明首先提供了长林小蠹SS-COI PCR检测引物,其中,所述长林小蠹SS-COIPCR检测引物由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.2所示的下游引物组成。
本发明的另一方面是提供了长林小蠹SS-COI PCR检测试剂盒,包括:2×FlashPCR MasterMix,长林小蠹SS-COI PCR检测引物,ddH2O;其中,所述长林小蠹SS-COI PCR检测引物由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.2所示下游引物组成
本发明的另一方面是提供了一种长林小蠹SS-COI PCR检测方法,包括:
(1)提取待检测样品DNA;
(2)以待检测样品DNA为模板,以长林小蠹SS-COI PCR检测上游引物HLSSCOIF和下游引物HLSSCOIR建立PCR扩增体系并进行PCR扩增反应;
(3)若待检测样品出现474bp的扩增条带,则待检测样品为长林小蠹。
作为本发明优选的具体实施方式,步骤(2)中所建立的PCR扩增体系为:2×FlashPCR MasterMix(Dye)12.5μL、上游引物HLSSCOIF 1μL、下游引物HLSSCOIR 1μL、基因组DNA模板1.5μL、ddH2O 9μL。
作为本发明的一种优选的具体实施方式,步骤(2)中所述的PCR扩增的反应程序为:98℃预变性30s,94℃变性10s,54℃或55℃退火15s,72℃延伸15s,共34个循环,最后72℃延伸1min。
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