[发明专利]用于诊断膀胱癌的方法在审
申请号: | 202310624907.4 | 申请日: | 2016-07-05 |
公开(公告)号: | CN116656821A | 公开(公告)日: | 2023-08-29 |
发明(设计)人: | 丹尼·弗鲁姆金;亚当·瓦瑟斯特罗姆 | 申请(专利权)人: | 纽克莱克斯有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16H50/20;G16H50/30;A61N5/10 |
代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人: | 王玮玮;郑霞 |
地址: | 以色列*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 诊断 膀胱癌 方法 | ||
1.一种用于鉴定人受试者中的膀胱癌的方法,所述方法包括:
(a)将来自从所述受试者获得的尿样品的DNA应用于用至少一种甲基化敏感性限制性内切核酸酶的消化,以获得限制性内切核酸酶处理的DNA;
(b)从所述限制性内切核酸酶处理的DNA共扩增包含SEQ ID NO:1中列出的基因座的至少一种限制性基因座和对照基因座,从而生成每种基因座的扩增产物;
(c)计算所述至少一种限制性基因座的每一种和所述对照基因座的扩增产物的信号强度之间的比率;以及
(d)检测所述比率相对于相应的膀胱癌参考比率的高概率评分,从而鉴定所述人受试者中的膀胱癌。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一种限制性基因座还包含SEQ ID NO:5中列出的基因座,并且其中所述高概率评分为SEQ ID NO:1的比率和SEQ ID NO:5的比率相对于它们相应的膀胱癌参考比率的高组合概率评分。
3.如权利要求2所述的方法,其中所述至少一种限制性基因座还包含SEQ ID NO:7中列出的基因座和SEQ ID NO:11中列出的基因座,并且其中所述高概率评分为所述SEQ ID NO:1的比率、所述SEQ ID NO:5的比率、SEQ ID NO:7的比率和SEQ ID NO:11的比率相对于它们相应的膀胱癌参考比率的高组合概率评分。
4.如权利要求3所述的方法,其中所述至少一种限制性基因座还包含选自SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:15中列出的基因座的组的至少一种另外的限制性基因座,其中所述高概率评分为所述SEQ ID NO:1的比率、所述SEQ IDNO:5的比率、所述SEQ ID NO:7的比率和所述SEQ ID NO:11的比率以及所述至少一种另外的限制性基因座的至少一种另外的比率相对于它们相应的膀胱癌参考比率的高组合概率评分。
5.如权利要求4所述的方法,其中所述至少一种另外的限制性基因座包括SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:15中列出的基因座。
6.如权利要求1所述的方法,所述方法还包括:
提供第一对照构建体和第二对照构建体,所述第一对照构建体和所述第二对照构建体包含非人DNA序列,其中所述第一对照构建体包含缺乏所述甲基化敏感性限制性内切核酸酶的识别序列的DNA序列,并且所述第二对照构建体包含含有所述甲基化敏感性限制性内切核酸酶的识别序列并且完全未被甲基化的DNA序列;
用所述甲基化敏感性限制性内切核酸酶消化所述第一对照构建体和所述第二对照构建体;以及
扩增所述第一对照构建体和所述第二对照构建体;
其中所述第一构建体的充分扩增伴随所述第二构建体的低扩增或不扩增的检测结果指示适当的DNA消化。
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