[发明专利]通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法及运算装置

权利要求书

1.一种通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法，其特征在于包括：

用待检测聚合酶对已知参考基因组序列的模板进行扩增，对扩增后的文库进行测序，获得原始测序数据；

提取、识别所述原始测序数据中Reads1和Reads2 Overlap区域的测序数据，并矫正所述Reads1和Reads2 Overlap区域的测序数据，将所述Reads1和Reads2 Overlap区域测序不一致的碱基标记和/或所述Reads1和Reads2 Overlap区域测序质量低于30的碱基进行标记，获得Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列；

保留所述Reads1和Reads2 Overlap长度大于等于50的区域，将所述Reads1和Reads2overlap区域矫正后的序列与所述参考基因组序列进行比对，输出错配结果，所述错配结果包含扩增后的文库相较于参考基因组序列总的以及不同碱基类型突变的分析结果。

2.根据权利要求1所述的通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法，其特征在于获得Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列具体是指：将Reads1和Reads2 Overlap区域测序不一致的碱基标记为N，将Reads1和Reads2 Overlap区域测序质量低于30的碱基也标记为N，从而获得Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列。

3.根据权利要求2所述的通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法，其特征在于输出的错配结果不包含由标记为N的碱基所产生的错配结果。

4.根据权利要求1所述的通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法，其特征在于测序采用二代测序的PE100及以上的测序模式。

5.根据权利要求1-4中任一项所述的通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法，其特征在于利用基因组比对软件将所述Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列与所述参考基因组序列进行比对。

6.一种通过二代测序技术检测聚合酶保真性的方法，其特征在于包括：

用待检测聚合酶对已知参考基因组序列的模板进行扩增，同时用已知参考基因组序列的模板建立PCR free文库，对扩增后的文库及PCR free文库进行测序，获得原始测序数据；

提取、识别所述原始测序数据中Reads1和Reads2 Overlap区域的测序数据，并矫正所述Reads1和Reads2 Overlap区域的测序数据，将所述Reads1和Reads2 Overlap区域测序不一致的碱基标记和/或所述Reads1和Reads2 Overlap区域测序质量低于30的碱基进行标记，获得Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列；

保留所述Reads1和Reads2 Overlap长度大于等于50的区域，使用软件将所述Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列与所述参考基因组序列进行比对，得到错配结果，所述错配结果包含扩增后的文库相较于参考基因组序列总的以及不同碱基类型突变的分析结果，再将待检测聚合酶扩增的错配结果减去PCR free文库的错配结果来过滤未矫正完全的测序错误，输出过滤后的错配结果。

7.一种基于处理器的运算装置，其特征在于，包括：

获取模块，用于获取原始测序数据；所述原始测序数据由用待检测聚合酶对已知参考基因组序列的模板进行扩增，对扩增后的文库进行测序后获得；或者所述原始测序数据由用待检测聚合酶对已知参考基因组序列的模板进行扩增，同时用已知参考基因组序列的模板建立PCR free文库，对扩增后的文库及PCR free文库进行测序后获得；

矫正模块，用于提取、识别并矫正所述原始测序数据；获得所述原始测序数据中Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列；

比对模块，用于将所述Reads1和Reads2 overlap区域矫正后的序列与所述参考基因组序列进行比对；

运算模块，用于将所述比对分析结果进行比对错配分析，输出错配结果。