[发明专利]一种与紫花苜蓿耐碱性相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与紫花苜蓿耐碱性相关的SNP分子标记及其应用。本发明所保护的一个技术方案是检测紫花苜蓿基因组中Chr7‑16804032位点的多态性或基因型(即等位基因)的组合物在鉴定或辅助鉴定紫花苜蓿耐碱性中的应用。可将检测Chr7‑16804032位点多态性和基因型的组合物与其他物质(如检测其他与紫花苜蓿耐碱性相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备鉴定耐碱性强的紫花苜蓿品种产品。

技术领域

本发明涉及分子标记的应用，特别涉及一种与紫花苜蓿耐碱性相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

紫花苜蓿为豆科苜蓿属多年生草本植物，产量高，蛋白质含量高，是优质的牧草。紫花苜蓿根系发达，主根粗大，能防水固土，防止水土流失，固土保墒，作为豆科植物，能改良土壤，具有固氮肥田的效果，对盐碱地有一定的改良效果。

分子标记辅助选择(marker assisted selection MAS)是基于基因型的选择，不受外界环境因素的影响，被越来越广泛地应用于育种实践中。SNP是single nucleotidepolymorphism的缩写，指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。CAPS是根据已知位点的DNA序列进行特异性引物设计，通过PCR技术扩增该位点附近的某一DNA片段，从而通过某一限制性内切酶对该片段进行识别并酶切，进而可用于鉴定或辅助鉴定SNP位点的多态性或基因型的一类分子标记。通过分子标记鉴定或辅助鉴定盐碱的紫花苜蓿材料，可选育出更多耐盐碱的紫花苜蓿品种。

发明内容

本发明所要解决的一个技术问题是如何鉴定或辅助鉴定紫花苜蓿耐碱性。

为了解决上述技术问题，本发明提供了下述A1-A3的任一种应用、A4的方法：

A1、检测紫花苜蓿基因组中Chr7-16804032位点的多态性或基因型(即等位基因)的物质在鉴定或辅助鉴定紫花苜蓿耐碱性中的应用；所述Chr7-16804032位点是紫花苜蓿基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或T，为SEQ ID No.1第92位核苷酸；

A2、检测紫花苜蓿基因组中Chr7-16804032位点的多态性或基因型(即等位基因)的物质在制备鉴定或辅助鉴定紫花苜蓿耐碱性产品中的应用；所述Chr7-16804032位点是紫花苜蓿基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或T，为SEQ ID No.1第92位核苷酸；

A3、检测紫花苜蓿基因组中所述Chr7-16804032位点的多态性或基因型(即等位基因)的物质在紫花苜蓿育种中的应用或在制备紫花苜蓿育种产品中的应用；所述Chr7-16804032位点是紫花苜蓿基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或T，为SEQ ID No.1第92位核苷酸。

所述育种的目的包括选育耐碱性强的紫花苜蓿。

A4、鉴定或辅助鉴定紫花苜蓿耐碱性的方法，包括检测待测紫花苜蓿的基因型，根据待测紫花苜蓿的基因型鉴定或辅助鉴定紫花苜蓿的耐碱性；所述基因型为紫花苜蓿基因组中所述Chr7-16804032位点的基因型；所述Chr7-16804032位点是紫花苜蓿基因组中的一个SNP位点，其核苷酸种类为G或T，为SEQ ID No.1第92位核苷酸。

本发明所要解决的另一个技术问题是如何进行紫花苜蓿育种。

为了解决上述技术问题，本发明提供了下述技术方案：

B1、A4所述的方法在紫花苜蓿育种中的应用。

所述育种的目的包括选育耐碱性强的紫花苜蓿。

B2、紫花苜蓿育种的方法，包括：检测紫花苜蓿基因组所述Chr7-16804032的多态性，选择紫花苜蓿基因组中所述Chr7-16804032位点为T的纯合型的紫花苜蓿作为亲本进行育种。