[发明专利]一种用于检测头颈鳞癌的核酸产品、试剂盒及应用

说明书

本发明属于生物医学领域，更具体地，涉及一种用于检测头颈鳞癌的核酸产品、试剂盒及应用。本发明提供的检测头颈鳞癌的核酸产品，通过检测样本中TRH基因上的靶区域的甲基化水平，能够有效区分头颈鳞癌患者和非癌患者，可用于检测不同类型的头颈鳞癌，包括喉癌、口腔癌和鼻咽癌。本发明提供的试剂盒通过检测样本中TRH基因上的任一靶区域的甲基化水平，对头颈鳞癌组织样本和血浆样本均具有较高的检测灵敏度和特异性。

技术领域

本发明属于生物医学领域，更具体地，涉及一种用于检测头颈鳞癌的核酸产品、试剂盒及应用。

背景技术

大多数头颈部癌症起源于口腔、咽部和喉部的黏膜上皮细胞，这些头颈部癌症被统称为头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)。口腔癌和喉癌通常与吸烟、酗酒有关，而咽癌则越来越多地归因于人乳头瘤病毒(HPV)的感染，尤其是HPV-16。因此，HNSCC通常可以分为HPV阳性或HPV阴性两大类。据统计，在2018年，全球范围内有89万HNSCC新发病例和45万死亡病例，且其发病率持续上升，预计到2030年其发病率将上浮30％(即每年约有108万新发病例)。尽管侵袭性HNSCC的组织学进展是从细胞非典型性增生(atypia)到细胞异型增生(dysplasia)再进展为癌的，但是大多数患者在确诊HNSCC时，疾病已经进入晚期且他们在临床上并没有明显的癌前病变，这给HNSCC患者的早诊早治疗带来了极大的困难。然而，在HNSCC的早期(即肿瘤细胞尚未发生转移时)确诊，可以显著提高患者的预后。因此，目前急需高灵敏度、高特异性的HNSCC的早期诊断方法，以改善患者的生存质量和生命周期。

异常的基因甲基化与癌症有着密切的关系，如抑癌基因启动子区域的高度甲基化会导致抑癌基因转录沉默，进而导致癌症发生和发展。因此，HNSCC中发生甲基化水平改变的基因可能作为其早期诊断的分子标志物，若可以通过液体活检的方法检测肿瘤细胞释放到体液中的表观遗传信息的变化，则可以对高危患者进行无创或微创诊断、从而提高早期HNSCC的检出率，进而提高患者的生存率。

目前临床上尚未有明确的可用于头颈鳞癌诊断的分子标志物，现有技术公开的一些用于诊断头颈鳞癌患者体液样本的分子标志物，其诊断性能仍需要进一步优化。因此，高灵敏度、高特异性的用于头颈鳞癌诊断的分子标志物仍然是急需的。

发明内容

针对现有技术的缺陷，本发明的目的在于提供一种用于检测头颈鳞癌的核酸产品、试剂盒及应用，以解决现有技术对于头颈鳞癌诊断的侵入性操作，诊断性能较差，尤其是对头颈鳞癌血浆样本的检测灵敏度和特异性较低，缺乏对喉癌、口腔癌、鼻咽癌等不同类型的头颈鳞癌的检测等问题。

为实现上述目的，本发明提供了一种用于检测头颈鳞癌的核酸产品，其为用于检测样本中TRH基因CpG岛上的靶区域的甲基化水平的核酸产品；

以GRCh38.p14为参考基因组，所述靶区域包括Chr3:129974443-129974790负链的全长区域或部分区域中的至少一个。

优选地，所述Chr3:129974443-129974790负链的部分区域包括Chr3:129974631-129974785、Chr3:129974657-129974765、Chr3:129974646-129974737、Chr3:129974512-129974676、Chr3:129974540-129974662和Chr3:129974443-129974616。

优选地，所述核酸产品包括用于检测所述靶区域的甲基化水平的引物对，可选地，还包括检测探针。

优选地，所述核酸产品包括用于检测所述Chr3:129974443-129974790负链的全长区域的甲基化水平的甲基化引物对和非甲基化引物对；进一步优选地，所述甲基化引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.16～17所示，所述非甲基化引物对的核苷酸序列如SEQ IDNO.18～19所示。