[发明专利]一种位于10号染色体上与DNA表观修饰相关的肿瘤标记物及其应用在审

专利信息
申请号: 202310262756.2 申请日: 2020-12-30
公开(公告)号: CN116083589A 公开(公告)日: 2023-05-09
发明(设计)人: 董世华;李振艳 申请(专利权)人: 上海奕谱生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;A61K45/00;A61P35/00
代理公司: 上海领誉知识产权代理有限公司 31383 代理人: 温爱飞
地址: 200233 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 位于 10 染色体 dna 表观 修饰 相关 肿瘤 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种肿瘤标记物,其特征在于,所述肿瘤标记物位于人类基因组10号染色体上,且包括一个或多个可发生甲基化修饰的CpG位点;其中,所述肿瘤标记物包括以人类基因组hg19作为参考版本位于chr10:50819227-50819589区域。

2.根据权利要求1所述的肿瘤标记物,其特征在于,所述肿瘤标记物包括作为乳腺癌、宫颈癌、食管癌、头颈部癌、肺癌和胰腺癌中的一种或几种的标记物。

3.根据权利要求2所述的肿瘤标记物,其特征在于,所述肿瘤标记物还包括作为膀胱癌、胆管癌、结肠癌、胶质母细胞瘤、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、肝癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、前列腺癌、肉瘤、黑色素瘤、胃腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、子宫内膜癌中的一种或几种的标记物。

4.根据权利要求1所述的肿瘤标记物,其特征在于,所述甲基化修饰包括5-醛甲基化修饰、5-羟甲基化修饰、5-甲基化修饰或5-羧甲基化修饰。

5.根据权利要求1所述的肿瘤标记物,其特征在于,所述chr10:50819227-50819589区域选自以下组中的至少一种:

a)SEQ ID NO.1所示的碱基序列;

b)SEQ ID NO.1所示的碱基序列的互补序列;

c)与SEQ ID NO.1至少70%同源性的核苷酸序列或其核苷酸序列的互补序列。

6.一种如权利要求1-5中任一项所述的肿瘤标记物的应用,其特征在于,所述应用选自以下应用中的一种:所述肿瘤标记物在制备肿瘤的筛选试剂、预后试剂、检测试剂或诊断试剂中的应用;所述肿瘤标记物在作为肿瘤的药物靶点中的应用;所述肿瘤标记物在制备抑制肿瘤增生的药物中应用;检测所述肿瘤标记物CpG位点甲基化水平的试剂在制备检测肿瘤的试剂中的应用。

7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述检测试剂为肿瘤标记物检测试剂盒,其包括特异性检测所述肿瘤标记物的引物或探针;和/或,所述抑制肿瘤增生的药物为所述肿瘤标记物的抑制剂。

8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述引物或探针为特异性检测所述肿瘤标记物CpG位点甲基化的引物或探针;所述抑制剂为甲基化抑制剂。

9.根据如权利要求6~8中任一项所述的应用,其特征在于,所述应用包括以下步骤:

S1、获取待检测组织样本;

S2、抽提待检测组织样本DNA,获取样本的甲基化值;

S3、计算出所述肿瘤标记物序列区域内的每个CpG位点的甲基化情况或整个区域的平均甲基化情况。

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,步骤S2所述的获取样本的甲基化值的方法包括:测序、探针、抗体、质谱。

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