[发明专利]用于单细胞测序的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法在审

专利信息
申请号: 202310054511.0 申请日: 2023-02-03
公开(公告)号: CN116334181A 公开(公告)日: 2023-06-27
发明(设计)人: 郝升;南春旭;李霞;丁悦;杨中正;许秀勤;王邹 申请(专利权)人: 武汉生物样本库有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 徐瑛
地址: 430000 湖北省武汉市东湖高新*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 用于 单细胞 oct 包埋 冰冻 组织 细胞核 提取 方法
【权利要求书】:

1.用于单细胞测序的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、切掉经过OCT包埋剂包埋的冰冻组织表面的OCT包埋剂,切片,剥离切片周围多余的OCT包埋剂;

S2、在所述切片中加入裂解液,进行研磨、裂解;

S3、加入洗涤液混匀,过细胞筛,离心弃上清;再加入洗涤液重悬、沉淀;

S4、吸取上层液体过枪头筛若干次,加入核悬液后离心弃上清,再加入核悬液重悬,完成细胞核提取。

2.根据权利要求1所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,步骤S1的具体方法为:将OCT包埋剂包埋冰冻组织固定在切片机上,切掉组织表面的OCT包埋剂,直至暴露出组织的最大切面后,收集若干片切片,剥离切片周围的多余OCT包埋剂。

3.根据权利要求1所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,步骤S2中,所述裂解液的原料和终浓度分别为:基础缓冲液1mL、NP400.2wt%、BSA 0.01wt%、RNaseinhibitor 1U/μL和无核酸无酶水。

4.根据权利要求3所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,所述基础缓冲液的原料和终浓度分别为:NaCl 292mM、Tris-HCl 20mM、CaCl2 2mM、MgCl2 42mM和无核酸无酶水。

5.根据权利要求1所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,所述S3中,所述洗涤液的原料和终浓度分别为:Tris-HCl 10mM、NaCl 10mM、MgCl2 3mM、BSA 1wt%、Tween-20 0.1%、DTT 1mM、RNase inhibitor 1U/μL和无核酸无酶水。

6.根据权利要求1所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,步骤S4中的核悬液的原料和终浓度分别为:BSA 1wt%、RNase inhibitor 1U/μL和PBS缓冲液。

7.根据权利要求1所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,步骤S4中,过枪头筛的具体方法是:用移液器吸取步骤S3处理后的上层液体1ml,将移液器头插在枪头筛中约0.5cm的深度,在枪头筛下方放置离心管,将所述上层液体打入离心管中;重复操作一次。

8.根据权利要求7所述的OCT包埋冰冻组织的细胞核提取方法,其特征在于,步骤S4中,所述枪头筛为过滤孔径40μm的枪头筛。

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