[发明专利]一种生物学年龄检测试剂盒和生物学年龄检测系统在审
| 申请号: | 202211555666.4 | 申请日: | 2022-12-06 |
| 公开(公告)号: | CN116103384A | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
| 发明(设计)人: | 倪晓琳;赵汉青;利荣乔;苏华斌;原慧萍;焦娟;杨泽;胡才友;孙亮;周起;朱小泉 | 申请(专利权)人: | 北京医院 |
| 主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B40/00;G16B20/30 |
| 代理公司: | 天津欣达睿诚知识产权代理事务所(普通合伙) 12216 | 代理人: | 李欣;孙琳 |
| 地址: | 100730 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 生物学 年龄 检测 试剂盒 系统 | ||
1.一种生物学年龄检测试剂盒,其特征在于:由与年龄相关的生化检测指标检测试剂、端粒长度检测试剂和外周血DNA甲基化位点检测试剂组成;
其中,与年龄相关的生化检测指标是指:谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(GOT)、ALT\GOT、肌酐(Cr)、空腹血糖(Glu)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL);
外周血DNA甲基化位点是指:cg05442902(P2RX6),cg06493994(SCGN),cg09809672(EDARADD),cg19722847(IPO8),and cg22736354(NHLRC1)。
2.根据权利要求1所述的一种生物学年龄检测试剂盒,其特征在于:所述生化检测指标检测试剂为ALT检测试剂、GOT检测试剂、Glu检测试剂、Cr检测试剂和LDL检测试剂。
3.根据权利要求1或2所述的一种生物学年龄检测试剂盒,其特征在于:所述端粒长度检测试剂为端粒相对长度检测试剂盒(定量PCR法)DL50试剂盒。
4.根据权利要求1所述的一种生物学年龄检测试剂盒,其特征在于:所述外周血DNA甲基化位点检测试剂包括:红细胞裂解液(RBC Lysis Buffer)、蛋白酶K(Proteinase K)、苯酚-氯仿、异丙醇、75%乙醇,以及检测cg09809672、cg19722847、cg22736354、cg05442902、cg06493994位点的引物序列。
5.根据权利要求4所述的一种生物学年龄检测试剂盒,其特征在于:所述引物序列为序列表SEQ ID No.5至SEQ ID No.14所示的核苷酸序列。
6.一种生物学年龄检测系统,其特征在于,包括以下步骤:
S1,通过试剂盒获取生化检测指标值、端粒长度值和外周血DNA甲基化位点值;
S2,获得ALT\GOT值;
S3,采用袋装算法和决策树算法定性预测生物学年龄;
S4,采用Rational Quadratic算法定量预测生物学年龄。
7.根据权利要求6所述的生物学年龄检测系统,其特征在于:所述S1的试剂盒由与年龄相关的生化检测指标检测试剂、端粒长度检测试剂和外周血DNA甲基化位点检测试剂组成;
其中,与年龄相关的生化检测指标是指:谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(GOT)、ALT\GOT、肌酐(Cr)、空腹血糖(Glu)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL);
外周血DNA甲基化位点是指:cg05442902(P2RX6),cg06493994(SCGN),cg09809672(EDARADD),cg19722847(IPO8),and cg22736354(NHLRC1)。
8.根据权利要求6所述的生物学年龄检测系统,其特征在于:所述生化检测指标检测试剂为ALT检测试剂、GOT检测试剂、Glu检测试剂、Cr检测试剂和LDL检测试剂;
所述端粒长度检测试剂为端粒相对长度检测试剂盒(定量PCR法)DL50试剂盒;
所述外周血DNA甲基化位点检测试剂包括:红细胞裂解液(RBC Lysis Buffer)、蛋白酶K(Proteinase K)、苯酚-氯仿、异丙醇、75%乙醇,以及序列表SEQ ID No.5至SEQ ID No.14所示的检测cg09809672、cg19722847、cg22736354、cg05442902、cg06493994位点的引物序列。
9.根据权利要求6所述的生物学年龄检测系统,其特征在于:所述S2获得ALT\GOT值,是外周血检测获得谷丙转氨酶和谷草转氨酶结果,然后计算谷丙转氨酶除以谷草转氨酶得到的数值。
10.根据权利要求6所述的生物学年龄检测系统,其特征在于:所述S3采用袋装算法和决策树算法定性预测生物学年龄,
得到袋装树的预测结果,其公式表达为:
决策树预期结果,如下公式所示:
上述公式中,概率分布hi的计算公式如下:
其中,p(xi)是变量特征x出现的概率,n是分类的数目,分类数目为2;
在训练完成后,应按照特征数据的格式要求准备预测数据,代入训练完成的袋装树模型,预测受试者的实际年龄大于或小于实际年龄;
所述S4采用Rational Quadratic算法定量预测生物学年龄,
本模型核函数为:
均方误差MSE的计算公式如下,要求均方误差应小于80,
公式中,为采样数据年龄相关变量真实数据集合,y为模型的预测值,n为样本量;
在训练完成后,应按照特征数据的格式要求准备预测数据,代入训练完成的RationalQuadratic方法模型,预测受试者的实际年龄数值。
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