[发明专利]与烟草黑胫病1号生理小种抗性基因wBS1_t连锁的SSR标记及其应用

说明书

本发明以高抗黑胫病1号生理小种的野生烟草斯托克通氏烟草(Nicotiana stocktonii)为起始材料，得到了两个与烟草黑胫病1号生理小种抗性基因wBS1_t紧密连锁的共显性SSR标记，用于检测烟草基因组DNA中是否存在烟草黑胫病1号生理小种抗性基因wBS1_t。本发明提供的SSR标记具有快捷、稳定、精准且低成本的特点，可以作为烟草黑胫病1号生理小种抗病育种中wBS1_t基因分子标记辅助选择。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及与烟草黑胫病1号生理小种抗性基因wBS1_t连锁的SSR标记及其应用。

背景技术

烟草黑胫病是世界烟草生产中危害最严重的病害之一。目前已报道的烟草黑胫病菌生理小种有4个。其中，0号生理小种是侵染烟草的优势生理小种；2号小种和3号小种目前尚未普遍发生。随着针对黑胫病0号生理小种的深入研究和大量具有黑胫病0号生理小种抗性烟草品种的推广应用，导致植烟土壤中黑胫病菌优势小种存在由0号转变为1号的巨大风险。

目前，烟叶生产上用于抗黑胫病1号小种的抗源主要集中在雪茄烟资源Beinhart1000和Florida301材料上。Vontimitta等进行了Beinhart 1000抗黑胫病QTL分析，检测到6个QTL与黑胫病抗性相关，贡献率最大的主效QTL位点位于8号连锁群(Vontimitta V,Lewis R S.Mapping of quantitative trait loci affectingresistance to Phytophthora nicotianae in tobacco(Nicotiana tabacum L.)lineBeinhart-1000.Mol Breeding,2012,29:89-98.)。Zhang等在Beinhart 1000-1中也定位到效应最大QTL(qBS7)，Ma等进一步分析了该QTL(定名为Phn7.1)的位置和效应，通过开发SNP提高标记密度，利用一系列近等基因系(NIL)将定位区间缩小到约3cM的区间，可用于分子标记辅助选择育种和候选基因克隆(Zhang Y,Guo X,Yan X,Ren M,Jiang C,Cheng Y,WenL,Liu D,Zhang Y,Sun M,Feng Q,Yang A,Chenga L.Identification of stablyexpressed QTL for resistance to black shank disease in tobacco(Nicotianatabacum L.)line Beinhart 1000-1.The Crop J.,2018,6:282-290；Ma J M,Heim C,Humphry M,Nifong J M,Lewis R S.Genetic analysis of Phn7.1,a major QTLconferring partial resistance to Phytophthora nicotianae in Nicotianatabacum.Mol Breeding,2019,39:11.)。Xiao等利用大田自然发病和温室人工接种的方法，对雪茄烟Florida301的黑胫病抗性进行了QTL分析，结果获得2个主效抗性QTLs(BingguangXiao,Katherine Drake,Vijay Vontimitta,Zhijun Tong,Xueting Zhang,Meiyun Li,Xiaodong Leng,Yongping Li and Ramsey S.Lewis.Location of genomic regionscontributing to Phytophthora nicotianae resistance in tobacco cultivarFlorida 301.Crop Sci.,2013,53:473-481.)。

中国专利申请202111361796.X(一种与雪茄烟Beinhart1000-1抗黑胫病基因qBS01紧密连锁的共显性SSR标记及其应用)具有雪茄烟抗源，且属于数量性状的烟草黑胫病1号生理小种抗性基因/QTL开发的标记。