本发明公开了一种与Ⅲ型烟草蔗糖酯基因qBMVSE471紧密连锁的共显性SSR分子标记及其应用；与Ⅲ型烟草蔗糖酯基因qBMVSE471紧密连锁的共显性SSR分子标记的编号为TMc42726和TMt09661，其PCR扩增产物核苷酸序列分别由SEQ ID No.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。与Ⅲ型烟草蔗糖酯基因qBMVSE471紧密连锁的共显性SSR分子标记在检测烟草基因组DNA中是否存在Ⅲ型烟草蔗糖酯基因qBMVSE471中的应用。本发明提供的与Ⅲ型烟草蔗糖酯基因qBMVSE471紧密连锁的共显性SSR分子标记具有精准、高效、稳定、便捷和低成本的特点，因此该分子标记可以作为烟草高香气品质育种中Ⅲ型蔗糖酯基因qBMVSE471分子标记辅助选择的应用。
本发明涉及一种与雪茄烟抗黑胫病基因紧密连锁的共显性SSR标记及其应用，所述的抗黑胫病基因qBS01为源自雪茄烟品种Beinhart1000‑1的数量性状基因位点，且具有黑胫病0、1号生理小种抗性。所述的与雪茄烟Beinhart1000‑1抗黑胫病基因qBS01紧密连锁的共显性SSR标记的编号为TMc14137和TMc14142，其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。所述的应用为所述的与雪茄烟Beinhart1000‑1抗黑胫病基因qBS01紧密连锁的共显性SSR标记在检测烟草基因组DNA中是否存在抗黑胫病基因qBS01中的应用。本发明所述的共显性SSR标记具有快捷、稳定、精准且低成本的特点，因此该分子标记可以作为烟草黑胫病0、1号生理小种抗病育种中qBS01基因分子标记辅助选择的应用。
本发明涉及一种与IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485紧密连锁的共显性SSR标记及其应用，所述的与IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485紧密连锁的共显性SSR标记的编号为TM50931和TM56908、TMc44058和TMc44049，其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ IDNo.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4、SEQ ID No.5和SEQ ID No.6、SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示。所述的应用为所述的与IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485紧密连锁的共显性SSR标记在检测烟草基因组DNA中是否存在IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485中的应用。本发明所述的共显性SSR标记具有精准、高效、稳定、便捷和低成本的特点，因此该分子标记可以作为烟草高香气品质育种中IV型蔗糖酯基因qBMVSE485分子标记辅助选择的应用。
本发明公开了一种用于烟草根黑腐病主效抗性位点筛选/检测的功能分子标记及其应用，其中每个功能分子标记包含正反两个引物。所述功能分子标记所用成对引物选自组A或B，其中组A为选自以下引物对中的任意两个：第一引物对由SEQ ID NO:1和NO:2组成，第二引物对由SEQ ID NO:3和NO:4组成，第三引物对由SEQ ID NO:5和NO:6组成，第四引物对由SEQ ID NO:7和NO:8组成；另有组B为选自以下引物对中的任意两个：第五引物对由SEQ ID NO:9和NO:10组成，第六引物对由SEQ ID NO:11和NO:12组成；第七引物对由SEQ ID NO:13和NO:14组成。该功能分子标记在烟草辅助育种中具备便捷、高效且呈二元性的特点。遗传效应分析表明，分子标记辅助选择导入RBRR1位点能够极显著提高栽培烟草根黑腐抗性。
本发明公开了一种与烟草叶型相关基因qLL和qWL，连锁SSR标记及其应用，所述的烟草叶型相关性状包含烟草叶片长度性状和烟草叶片宽度性状，且控制上述两个性状的基因分别为qLL和qWL。所述的与烟草叶型相关基因qLL和qWL紧密连锁的共显性SSR标记的编号为TMs06601和TM16362，其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。所述的应用为所述的与烟草叶型相关基因qLL和qWL紧密连锁的共显性SSR标记在检测烟草基因组DNA中是否存在叶型相关基因qLL和qWL中的应用。本发明所述的共显性SSR标记具有快捷、稳定、精准且低成本的特点，因此该分子标记可以作为烟草叶型相关性状育种中qLL和qWL基因分子标记辅助选择的应用。
本发明公开了一种与烟草叶数基因qLN紧密连锁的共显性SSR标记及其应用，所述的与烟草叶数基因qLN紧密连锁的共显性SSR标记的编号为PT51248和TM51844，其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示。所述的应用为所述的与烟草叶数基因qLN紧密连锁的共显性SSR标记在检测烟草基因组DNA中是否存在烟草叶数基因qLN中的应用。本发明所述的共显性SSR标记具有稳定、可靠、简便、快捷和低成本的特点，因此该分子标记可以作为烟草产量育种中叶数基因qLN分子标记辅助选择的应用。
本发明属于烟草育种领域，涉及用于抗斑萎病烟草8号染色体背景筛选的引物组及其应用。提供用于抗斑萎病烟草育种背景筛选的PCR引物组合，包括第一PCR引物组和/或第二PCR引物组；所述第一PCR引物组由核苷酸序列如SEQ ID NO:1‑3所示的三条引物组成；所述第二PCR引物组由核苷酸序列如SEQ ID NO:4‑6所示的三条引物组成；所述抗斑萎病烟草为供体亲本Polalta烟草和受体亲本K326烟草的杂交及回交后代。本发明的引物组可用于早世代筛选具有K326烟草背景的抗斑萎病烟草，极大地缩短K326抗斑萎病定向改良的育种周期，提高育种效率。
