[发明专利]预测或检测圆锥角膜的生物标志物组合及检测剂和应用

说明书

本发明公开了预测或检测圆锥角膜的生物标志物组合及检测剂和应用。所述生物标志物组合包括以下SNP位点：rs121912863、rs372606845、rs201648982、rs142093416、rs752452590、rs541270955、rs121909212、rs118020901、rs201716527和rs74315433。所述生物标志物组合在预测或检测圆锥角膜发病方面具有高准确性、特异性和灵敏度，尤其适合对东亚人人群进行预测或检测。所述检测剂具有良好的扩增和检测能力，能够精确地在样本中检测出所述生物标志物。

技术领域

本发明属于疾病检测领域，具体涉及一种预测或检测圆锥角膜的生物标志物组合及检测剂和应用。

背景技术

角膜屈光手术的安全性及有效性近年来陆续被大量证实[1](D Wen,CMcalinden,I Flitcroft,等.Postoperative Efficacy,Predictability,Safety,andVisual Quality of Laser Corneal Refractive Surgery:A Network Meta-analysis.)，逐步被广大医生和患者所接受，每年拟行角膜屈光手术的人数约100万例(李莹.重视激光角膜屈光手术快速发展中的手术并发症问题[J].中华眼科杂志,2018,54(10):5.)。根据2015年激光角膜屈光手术临床诊疗专家共识，激光板层角膜屈光手术和激光表层角膜屈光手术的绝对禁忌症都包含圆锥角膜，相对禁忌症都包含角膜基质或内皮营养不良(中华医学会眼科学分会角膜病学组.激光角膜屈光手术临床诊疗专家共识(2015年))。临床中有明确临床体征的圆锥角膜相对容易诊断，但对于临床体征不明显，又有行屈光手术意愿的人群，筛查出早期圆锥角膜是保障手术安全有效的前提。家族性遗传在圆锥角膜的发病机制中起着重要的作用。目前已分析识别出多个可能存在圆锥角膜相关突变基因位点(WheelerJ,Hauser MA,Afshari NA,Allingham RR,Liu Y.The Genetics of Keratoconus:AReview.Reprod Syst Sex Disord.2012Jun 3；(Suppl 6):001.doi:10.4172/2161-038X.S6-001.PMID:23795306；PMCID:PMC3686480.)，未来角膜屈光术前行圆锥角膜的基因筛查有望成为协助明确早期圆锥角膜诊断的有效手段之一。但是我国现仅仅只针对圆锥角膜或TGFβI基因的部分位点进行了引物设计并进行检测，并没有用于预测或检测圆锥角膜相关多基因的热点设计。

发明内容

针对现有技术中尚未有预测或检测圆锥角膜的生物标志物组合的技术缺陷，本发明利用OMIM、HGMD和gnomAD数据库根据致病性和东亚人群频率筛选出了一种预测或检测圆锥角膜的生物标志物组合及检测剂，以及所述标志物组合或检测剂在制备预测或检测圆锥角膜的试剂盒中的应用。所述生物标志物组合在预测或检测圆锥角膜发病方面具有高准确性、特异性和灵敏度，尤其适合对东亚人人群进行预测或检测。所述检测剂具有良好的扩增和检测能力，能够精确地在样本中检测出所述生物标志物。

为解决上述技术问题，本发明提供的一个技术方案为：一种预测或检测圆锥角膜的生物标志物组合，所述生物标志物组合包括以下SNP位点中的一个或多个：rs121912863、rs372606845、rs201648982、rs142093416、rs752452590、rs541270955、rs121909212、rs118020901、rs201716527和rs74315433。

在本发明一具体实施例中，所述生物标志物组合由以下SNP位点组成：rs121912863、rs372606845、rs201648982、rs142093416、rs752452590、rs541270955、rs121909212、rs118020901、rs201716527和rs74315433。