[发明专利]一株耐多粘菌素产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌EC382-2-2及其应用

说明书

本发明公开了一株耐多粘菌素产超广谱β‑内酰胺酶大肠杆菌EC382‑2‑2及其应用。本发明的大肠杆菌EC382‑2‑2，于2022年10月27日保藏于广东省微生物菌种保藏中心(GDMCC)，地址为中国广东省广州市先烈中路100号大院59号楼5楼，其保藏号为GDMCC No：62929。所述大肠杆菌EC382‑2‑2同时携带eae毒力基因、质粒介导的耐多粘菌素基因mcr‑1、超广谱β‑内酰胺酶基因CTX‑M‑55，以及其他抗生素耐药基因。大肠杆菌EC382‑2‑2携带18种耐药基因并对多种抗生素产生高水平耐药，可作为筛选新型抗菌药物的模式菌株，具有良好的应用前景。

技术领域：

本发明涉及耐药致病菌技术领域，尤其涉及一株耐多粘菌素产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌EC382-2-2及其应用。

背景技术：

大肠杆菌O157是一种重要的人畜共患病病原菌，可引起人和动物腹泻、出血性肠炎和溶血性尿毒综合症等疾病，给食品安全和人类健康造成严重威胁。E.coli O157包含多个H型，其中O157:H7是国内外研究最多的一类血清型，具有高致死率。除O157:H7外，近年来多种其他H型被报道与人类严重感染相关，例如O157:H45、O157:H26、O157:H2和O157:H16等。食用受E.coli O157污染的肉类蔬菜等是食物中毒的主要原因。目前，E.coli O157仍是世界各国重点追踪和监测的重要病原菌。

抗生素对于大肠杆菌(包括大肠杆菌O157)感染治疗具有一定辅助作用，但是随着抗生素在畜牧养殖和临床的广泛/过度使用，大肠杆菌及大肠杆菌O157耐药性逐年增加，多重耐药菌株在动物、食品和环境中不断扩散。泛耐药菌株可通过食品传播给人类，给临床和畜牧业细菌感染治疗带来新挑战。当前，耐药菌株的流行和蔓延已成为一个重要的公共卫生问题。文献资料显示，大肠杆菌对多数喹诺酮类药的耐药率高达50％，三代头孢的耐药率达到20％以上，且五重、六重、七重耐药情况占主导。多粘菌素(Colistin)被认为是治疗多重耐药革兰氏阴性菌感染的最后选择。然而自2015年我国首次报道质粒介导黏菌素耐药基因mcr-1以来，耐多粘菌素大肠杆菌在全球范围报道逐渐增多。Mcr-1基因通过可转移质粒在不同的细菌中水平传播，导致新的多重耐药和泛耐药菌开始出现。截止目前，质粒介导的mcr-1基因已经在大肠杆菌、沙门氏菌、肺炎克雷伯氏菌等多种肠杆菌科细菌中检出，部分菌株同时携带超广谱β-内酰胺酶类ESBL基因和mcr-1基因，导致对三代头孢和多粘菌素产生抗性，进一步限制了抗生素的选择，增加了疾病治疗的难度。

持续追踪监测新耐药菌的出现，及时更新报告耐药菌扩散情况，逐步完善数据共享服务平台，对于开发新型药物、保障人类健康具有重要意义。

发明内容：

为克服现有技术的不足，本发明提供一株同时携带多重耐药基因和毒力基因的大肠杆菌O157新菌株-大肠杆菌EC382-2-2及其应用，该菌株为国际上首次报道，可作为筛选新型抗菌药物的模式菌株，具有良好的应用前景。

本发明的第一个目的是提供一株致病大肠杆菌(atypical enteropathogenicEscherichia coli,aEPEC)EC382-2-2，其分类命名为大肠杆菌(Escherichia coli)EC382-2-2，保藏于广东省微生物菌种保藏中心(GDMCC)，保藏地址为中国广东省广州市先烈中路100号大院59号楼5楼，邮编：510070，保藏日期为2022年10月27日，保藏编号为GDMCC No：62929。

本发明提供的大肠杆菌EC382-2-2，属于血清型O157:H26，同时携带18种耐药基因和1种毒力基因，其所携带基因如下：

耐药基因：ant(2’)-Ia，aph(3’)-Ib，aph(3’)-IIa，aph(3’)-XV，aph(6’)-Id，floR，catB3，CTX-M-55，OXA-4，TEM-214，mcr-1，dfrA1，fosA3，mdf(A)，oqxA，oqxB，sul2，tet(A)；