[发明专利]SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列

说明书

本发明公开了一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列。本发明提供的SNP标记包括8个SNP位点中的多个或全部，能够对选自DBA/2、FVB、BALB/cJ、C57BL/6、C57BL/6‑bg、NPI、NCPC/2、NU/J、C3H、T739的10种近交系小鼠品系中的部分或全部进行鉴定，提高了近交系小鼠品系鉴定的范围和效率。

技术领域

本发明属于小鼠品系鉴定的技术领域，具体涉及一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列。

背景技术

实验动物是指经人工饲育且对其携带的微生物实行控制、遗传背景明确或者来源清楚、用于科学研究、教学、生产、检定以及其他科学实验的动物。常见的实验动物有实验大鼠和实验小鼠，包括有数千种封闭群、近交系、重组同类系、重组近交系和突变系等品系。

在常见的、历史比较久的多种近交系小鼠品系中，各小鼠品系之间的遗传差异较大。但是，在表观遗传学性状上差异却并不大，几乎无法单纯从外观上来鉴定近交系小鼠品系。随着生命医学的发展，科研人员和商业对实验动物质量的要求越来越高。因此，对近交系小鼠品系的鉴定成了亟待解决的问题。

专利文献CN114507744A(以下称文献1)公开一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用以及鉴定引物序列，其采用15个SNP位点能够同时鉴定出C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/CaJ和C3H 7种近交系小鼠品系。然而，一方面，该文献1需要采用15个SNP位点以及扩增这些SNP位点的15对引物序列才能对其公开的7种近交系小鼠品系进行鉴定，因此该文献1采用的SNP位点和扩增这些SNP位点的引物序列较多，而同时鉴定的近交系小鼠品系较少，增加了鉴定的成本；另一方面，该文献1在使用其公开的15对引物对15个SNP位点进行扩增时，针对每个样本需要进行15次扩增反应，因此操作繁琐，会造成鉴定花费的时间较多，降低了近交系小鼠品系的鉴定效率。

发明内容

针对现有技术中存在的问题的一个或多个，本发明一个方面提供一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，其利用8个SNP位点中的多个或全部对10种近交系小鼠品系中的部分或全部进行鉴定，所述8个SNP位点分别命名为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8，所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc-bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、和T739/Nifdc；其中：

所述SNP1的Ensembl rs编号为rs3023039，其等位基因为T或C；

所述SNP2的Ensembl rs编号为rs3089109，其等位基因为C或G；

所述SNP3的Ensembl rs编号为rs3712692，其等位基因为G或T；

所述SNP4的Ensembl rs编号为rs3022977，其等位基因为C或T；

所述SNP5的Ensembl rs编号为rs3709624，其等位基因为T或C；

所述SNP6的Ensembl rs编号为rs3022825，其等位基因为T或C；

所述SNP7的Ensembl rs编号为rs3089984，其等位基因为A或C；

所述SNP8的Ensembl rs编号为rs3023436，其等位基因为T或A。