[发明专利]SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列

权利要求书

1.一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，其特征在于，利用8个SNP位点中的多个或全部对10种近交系小鼠品系中的部分或全部进行鉴定，所述8个SNP位点分别命名为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8，所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc-bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、和T739/Nifdc；其中：

所述SNP1的Ensembl rs编号为rs3023039，其等位基因为T或C；

所述SNP2的Ensembl rs编号为rs3089109，其等位基因为C或G；

所述SNP3的Ensembl rs编号为rs3712692，其等位基因为G或T；

所述SNP4的Ensembl rs编号为rs3022977，其等位基因为C或T；

所述SNP5的Ensembl rs编号为rs3709624，其等位基因为T或C；

所述SNP6的Ensembl rs编号为rs3022825，其等位基因为T或C；

所述SNP7的Ensembl rs编号为rs3089984，其等位基因为A或C；

所述SNP8的Ensembl rs编号为rs3023436，其等位基因为T或A。

2.权利要求1所述的SNP标记在制备用于鉴定近交系小鼠品系的试剂盒或液相芯片中的应用，其特征在于，所述试剂盒或液相芯片用于检测所述近交系小鼠品系的8个SNP位点的等位基因；其中所述8个SNP位点分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8，所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc-bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、T739/Nifdc。

3.一种用于扩增权利要求1所述的SNP标记的引物组合，其特征在于，所述引物组合用于鉴定近交系小鼠品系，包括用于扩增SNP1位点的第一引物、用于扩增SNP2位点的第二引物、用于扩增SNP3位点的第三引物、用于扩增SNP4位点的第四引物、用于扩增SNP5位点的第五引物、用于扩增SNP6位点的第六引物、用于扩增SNP7位点的第七引物、用于扩增SNP8位点的第八引物，且所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc-bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、T739/Nifdc；

可选地，

所述第一引物包括SNP1-F和SNP1-R，其中所述SNP1-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述SNP1-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示；

所述第二引物包括SNP2-F和SNP2-R，其中所述SNP2-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示，所述SNP2-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示；

所述第三引物包括SNP3-F和SNP3-R，其中所述SNP3-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示，所述SNP3-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示；

所述第四引物包括SNP4-F和SNP4-R，其中所述SNP4-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示，所述SNP4-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示；

所述第五引物包括SNP5-F和SNP5-R，其中所述SNP5-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示，所述SNP5-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示；

所述第六引物包括SNP6-F和SNP6-R，其中所述SNP6-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示，所述SNP6-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示；

所述第七引物包括SNP7-F和SNP7-R，其中所述SNP7-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:13所示，所述SNP7-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:14所示；

所述第八引物包括SNP8-F和SNP8-R，其中所述SNP8-F的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示，所述SNP8-R的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示。