[发明专利]疟原虫数字PCR快速检测体系及检测方法在审
申请号: | 202211319240.9 | 申请日: | 2022-10-26 |
公开(公告)号: | CN115725766A | 公开(公告)日: | 2023-03-03 |
发明(设计)人: | 关明;蒋浩琴;董柳;张选;王雅琦;张昉 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院;苏州锐讯生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/90 |
代理公司: | 北京唐颂永信知识产权代理有限公司 11755 | 代理人: | 刘伟 |
地址: | 200040 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 疟原虫 数字 pcr 快速 检测 体系 方法 | ||
1.一组用于特异性扩增疟原虫基因的PCR引物,其特征在于,所述引物包含如SEQ IDNO:1所示的正向引物、和如SEQ ID NO:2所示的反向引物。
2.一组用于特异性筛查三日疟原虫的引物和探针组合,其特征在于,所述引物对包含如SEQ ID NO:1所示的正向引物、如SEQ ID NO:2所示的反向引物,所述探针包含如SEQ IDNO:3所示的探针。
3.一组用于特异性筛查卵形疟原虫的引物和探针组合,其特征在于,所述引物对包含如SEQ ID NO:1所示的正向引物、如SEQ ID NO:2所示的反向引物,所述探针包含如SEQ IDNO:4和/或SEQ ID NO:5所示的探针。
4.一组用于特异性筛查恶性疟原虫的引物和探针组合,其特征在于,所述引物对包含如SEQ ID NO:1所示的正向引物、如SEQ ID NO:2所示的反向引物,所述探针包含如SEQ IDNO:6所示的探针。
5.一组用于特异性筛查间日疟原虫的引物和探针组合,其特征在于,所述引物对包含如SEQ ID NO:1所示的正向引物、如SEQ ID NO:2所示的反向引物,所述探针包含如SEQ IDNO:7所示的探针。
6.一种基于PCR方法筛查或辅助筛查疟原虫的引物和探针组合,其特征在于,所述引物对包含如SEQ ID NO:1所示的正向引物、如SEQ ID NO:2所示的反向引物,所述探针包含如SEQ ID NO:3至SEQ ID NO:7所示的探针中的任意一条、任意两条、任意三条、任意四条、或五条。
7.根据权利要求2-6中任一项权利要求所述的引物和探针组合,其特征在于,所述探针序列的5’端标记有荧光报告基团,所述探针序列的3’端标记有荧光淬灭基团;当所述探针位于同一反应体系时,其中筛选不同种类疟原虫的荧光报告基团光谱范围不同。
8.根据权利要求7所述的引物和探针组合,其特征在于,所述荧光报告基团选自FAM、VIC、ROX、Cy5和/或HEX;所述荧光淬灭基团选自BHQ1、BHQ2、BHQ3、和/或Eclipse。
9.根据权利要求8所述的引物和探针组合,其特征在于:其中使用的各探针及其5’端标记的荧光报告基团和3’端标记的荧光淬灭基团如下:
筛选三日疟原虫的探针如SEQ ID NO:3所示,其5’端荧光标记为FAM,3’端荧光标记为BHQ1;筛选卵形疟原虫W亚型的探针如SEQ ID NO:4所示,其5’端荧光标记为VIC,3’端荧光标记为BHQ1;筛选卵形疟原虫C亚型的探针如SEQ ID NO:5所示,其5’端荧光标记为VIC,3’端荧光标记为BHQ1;筛选恶性疟原虫的探针如SEQ ID NO:6所示,其5’端荧光标记为ROX,3’端荧光标记为BHQ2;筛选间日疟原虫的探针如SEQ ID NO:7所示,其5’端荧光标记为Cy5,3’端荧光标记为BHQ3。
10.如权利要求6-9任一项权利要求所述的引物和探针组合,其为数字PCR(dPCR)反应所用的引物和探针组合。
11.一种筛查疟原虫的数字PCR反应预混液,其特征在于,所述数字PCR反应预混液包含如权利要求1-9任一项所述的引物和/或探针。
12.根据权利要求11所述的数字PCR反应预混液,其还包括选自以下的一种、两种、三种、四种或五种组分:热启动Taq酶、UDG酶、dNTPs,牛血清白蛋白和Mg2+离子。
13.一种数字PCR微流控卡盒,其含有权利要求11或权利要求12所述的数字PCR反应预混液。
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