[发明专利]烟草易感南美红辣椒脉斑驳病毒的RT-LAMP检测引物、检测方法及其试剂盒在审
申请号: | 202211298121.X | 申请日: | 2022-10-21 |
公开(公告)号: | CN115725793A | 公开(公告)日: | 2023-03-03 |
发明(设计)人: | 姜宁;刘雅婷;张俊蕾;盖晓彤;卢灿华;夏振远;马俊红;赵正婷;马俊美 | 申请(专利权)人: | 云南省烟草农业科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12N15/11;C12Q1/6844;C12R1/94 |
代理公司: | 成都市鼎宏恒业知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51248 | 代理人: | 张勋 |
地址: | 650000*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 烟草 南美 红辣椒 斑驳 病毒 rt lamp 检测 引物 方法 及其 试剂盒 | ||
1.一种烟草易感南美红辣椒脉斑驳病毒的RT-LAMP检测引物,其特征在于,RT-LAMP检测引物为CH-CP-3或CH-CP-4;其中
上表中外引物为CH-CP-F3-n、CH-CP-B3-n;
内引物为CH-CP-FIP-n、 CH-CP-BIP-n;
环引物为CH-CP-LF-n、 CH-CP-LB-n;其中n=3或4。
2.根据权利要求1所述的RT-LAMP检测引物,其特征在于,烟草易感南美红辣椒脉斑驳病毒的RT-LAMP检测引物为CH-CP-3。
3.根据权利要求1所述的RT-LAMP检测引物,其特征在于,烟草易感南美红辣椒脉斑驳病毒的RT-LAMP检测引物为CH-CP-3时,RT-LAMP检测灵敏度为原RNA浓度的10-7。
4.一种烟草易感南美红辣椒脉斑驳病毒的RT-LAMP检测方法,其特征在于,以待测样品的RNA为模板,采用如权利要求1~3中任一项所述的RT-LAMP引物进行RT-LAMP扩增反应;反应结束后观察RT-LAMP扩增反应溶液颜色变化,若反应液显绿色,则判断待测样品感染南美红辣椒脉斑驳病毒为阳性结果;若反应液显橙黄色,则判断待测样品未感染南美红辣椒脉斑驳病毒为阴性结果;
优选地,将RT-LAMP扩增反应溶液置于紫外灯下,若反应液发出白色荧光,则判断待测样品感染南美红辣椒脉斑驳病毒为阳性结果;若反应液不发出白色荧光,则判断待测样品未感染南美红辣椒脉斑驳病毒为阴性结果。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,RT-LAMP扩增反应温度为59~69℃;
更优选地,RT-LAMP扩增反应温度为63℃。
6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,RT-LAMP扩增反应时间为30~80min;
更优选地,RT-LAMP扩增反应时间为50~60min;
更优选地,RT-LAMP扩增反应时间为50min。
7.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,RT-LAMP扩增反应体系中甜菜碱溶液浓度为0~1.6mmol/μl;
更优选地,RT-LAMP扩增反应中甜菜碱溶液浓度为1.0~1.4mmol/μl;
更优选地,RT-LAMP扩增反应中甜菜碱溶液浓度为1.0mmol/μl。
8.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,RT-LAMP扩增反应体系中dNTPs溶液浓度为0~2.2mmol/μl;
更优选地,RT-LAMP扩增反应体系中dNTPs溶液浓度为0.2mmol/μl。
9.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,RT-LAMP扩增反应体系中Mg2+溶液浓度为2~8mmol/μl;
更优选地,RT-LAMP扩增反应中Mg2+溶液浓度为4mmol/μl;
优选地,RT-LAMP扩增反应体系中内外引物浓度比为1:1~8:1;
更优选地,RT-LAMP扩增反应体系中内外引物浓度比为4:1。
10.一种烟草易感南美红辣椒脉斑驳病毒的RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于,包括如上述的引物,检测试剂盒内以待测样品的RNA为模板,利用所述引物进行RT-LAMP扩增反应;反应结束后观察RT-LAMP扩增反应溶液颜色变化,若反应液显绿色,则判断待测样品感染南美红辣椒脉斑驳病毒为阳性结果;若反应液显橙黄色,则判断待测样品未感染南美红辣椒脉斑驳病毒为阴性结果;
该试剂盒中RT-LAMP扩增反应参数按权利要求4~9中任一项选取。
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