[发明专利]基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物、扩增建库方法及应用在审
申请号: | 202211004947.0 | 申请日: | 2022-08-22 |
公开(公告)号: | CN115198002A | 公开(公告)日: | 2022-10-18 |
发明(设计)人: | 毛凌峰;杨狄;唐旖 | 申请(专利权)人: | 杭州柏熠科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/689;C12Q1/6869;C40B50/06 |
代理公司: | 杭州汇和信专利代理有限公司 33475 | 代理人: | 吴琰 |
地址: | 310000 浙江省杭州市滨江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 纳米 孔测序仪 靶向 扩增 引物 方法 应用 | ||
1.一种基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物,其特征在于,由依次排序的定位序列、分子标签序列和扩增引物组成。
2.根据权利要求1所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物,其特征在于,扩增引物为16s基因通用引物。
3.根据权利要求2所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物,其特征在于,扩增引物为覆盖16srDNA基因全长的16s基因通用引物。
4.根据权利要求1所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物,其特征在于,分子标签序列的3’端接在扩增引物的5’端,分子标签序列的5’端连接定位序列。
5.一种基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法,其特征在于,包括:
针对待测序序列设计至少一靶向扩增引物,其中每一所述靶向扩增引物为定位序列、分子标签序列和扩增引物序列的组合序列;
将靶向扩增引物和待测序序列混合进行靶向扩增,得到扩增产物;
对所述扩增产物进行末端修复后连接接头。
6.根据权利要求5所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法,其特征在于,经过靶向扩增后的多个扩增产物混样建库得到单一样品,对单一样品进行末端修复。
7.根据权利要求5所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法,其特征在于,至少一分子标签序列和至少一扩增引物结合形成多个靶向扩增引物。
8.根据权利要求5所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法,其特征在于,扩增引物为16s基因通用引物。
9.根据权利要求5所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法,其特征在于,分子标签序列的3’端接在扩增引物的5’端,分子标签序列的5’端连接定位序列。
10.一种基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法的应用,其特征在于,采用权利要求5-9任一所述的基于纳米孔测序仪的靶向扩增引物的扩增建库方法对细菌进行纳米孔测序。
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