[发明专利]微生物菌种通量验证和评价方法、系统、设备、存储介质在审
申请号: | 202210981007.0 | 申请日: | 2022-08-16 |
公开(公告)号: | CN115521988A | 公开(公告)日: | 2022-12-27 |
发明(设计)人: | 江龙飞;罗春玲;孙迎韬;李继兵;张干 | 申请(专利权)人: | 中国科学院广州地球化学研究所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6895;C12Q1/6844;G16B30/00 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 劳剑东;邓潮彬 |
地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 微生物 菌种 通量 验证 评价 方法 系统 设备 存储 介质 | ||
本发明公开了一种微生物菌种通量验证和评价方法、系统、设备、存储介质,涉及微生物菌种验证技术领域,本发明的方法包括:将n种微生物排号后编制成N维等长数组,其中,每个微生物标记为AiBjCk…Nm,依次从A、B、C…N中选取一个字母,将该字母下标相同的所有微生物混合为一组用于16S rRNA扩增的子样品,并赋予该子样品一条码标签,总共获得z*N组待扩增样品,z为待样品扩增测序后,根据所述条码标签获得每一个微生物的16S rRNA序列。本发明能够节约上百倍的扩增和测序成本,能够高效低成本地完成已有微生物物种验证。
技术领域
本发明涉及微生物菌种验证技术领域,具体涉及一种微生物菌种通量验证和评价方法、系统、设备、存储介质。
背景技术
目前,微生物分离技术日趋成熟,大量微生物的存在为微生物研究和利用带来了大量便利。然而,微生物传代培养过程中不可避免会存在污染问题,需要在传代过程中对已知微生物菌种进行再验证。现有验证方法是直接对16S rRNA基因进行扩增测序,耗费大量人力和物力。菌种库中微生物种类具有特异性,每个验证的微生物均具有不同16S rRNA序列,基于此,我们设计了一种新的方法,可以节约上百倍的扩增和测序成本,能够高效低成本地完成已有微生物物种验证。
发明内容
针对现有技术中的不足,本发明提供一种微生物菌种通量验证和评价方法、系统、设备、存储介质,其能够节约上百倍的扩增和测序成本,能够高效低成本地完成已有微生物物种验证。
为实现上述目的,本发明可以采用以下技术方案进行:
第一方面,本发明提供一种微生物菌种通量验证方法,其包括:
将n种微生物排号后编制成N维等长数组,其中,每个微生物标记为AiBjCk…Nm,
依次从A、B、C…N中选取一个字母,将该字母下标相同的所有微生物混合为一组用于16S rRNA扩增的子样品,并赋予该子样品一条码标签,总共获得z*N组待扩增样品,z为
待样品扩增测序后,根据所述条码标签获得每一个微生物的16S rRNA序列。
同时,本发明提供一种用于评价上述的微生物菌种通量验证方法的方法,其包括:
通过节约成本的倍数P来评价,其中,
第二方面,本发明提供一种微生物菌种通量验证系统,其包括:
标记器,其用于将n种微生物排号后编制成N维等长数组,其中,每个微生物标记为AiBjCk…Nm,
分类编码器,其用于依次从A、B、C…N中选取一个字母,将该字母下标相同的所有微生物混合为一组用于16S rRNA扩增的子样品,并赋予该子样品一条码标签,总共获得z*N组待扩增样品,z为
序列输出器,其用于待样品扩增测序后,根据所述条码标签获得每一个微生物的16SrRNA序列。
同时,本发明提供一种用于评价上述的微生物菌种通量验证系统的系统,其包括:
节约成本倍数输出器,其用于输出节约成本的倍数P,其中,
第三方面,本发明提供一种电子设备,所述电子设备包括处理器和存储器,所述存储器中存储有至少一条指令、至少一段程序、代码集或指令集,所述至少一条指令、所述至少一段程序、所述代码集或指令集由所述处理器加载并执行以实现上述的微生物菌种通量验证方法。
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