[发明专利]患有实体癌症的患者的分类方法在审
申请号: | 202210976807.3 | 申请日: | 2017-05-09 |
公开(公告)号: | CN115198018A | 公开(公告)日: | 2022-10-18 |
发明(设计)人: | 热罗姆·加隆;贝恩哈德·米雷克尼克;弗兰克·帕格斯 | 申请(专利权)人: | 法国国家卫生及研究医学协会;索邦大学;巴黎西岱大学;公共事业救济局-巴黎医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G16H50/20;G16H50/30 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 杨青;郭翠霞 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 患有 实体 癌症 患者 分类 方法 | ||
1.两种或更多种生物标志物在制备用于通过包括以下步骤的方法对患有实体癌症的患者的存活时间进行预后的试剂盒或装置中的用途:
a)对所述两种或更多种生物标志物进行定量,其中所述两种或更多种生物标志物指示所述患者针对所述癌症的免疫应答的状态,并且在从所述患者获得的肿瘤样品中对每一种生物标志物进行定量;
b)将在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值与从患有所述癌症的患者的参比组对于所述两种或更多种生物标志物中的每一种所获得的值的分布进行比较;
c)对于在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值确定与在步骤a)中获得的值相对应的分布的百分位数;
d)计算所述百分位数的算术平均值或中值;以及
e)将在步骤d)中获得的所述百分位数的算术平均值或中值与百分位数的预定的参比算术平均值或预定的中值进行比较,预定的参比值与存活时间有关;
其中所述两种或更多种生物标志物包括与免疫应答相关的基因的表达。
2.两种或更多种生物标志物在制备用于通过包括以下步骤的方法评估患有实体癌症的患者对抗肿瘤治疗的响应性的试剂盒或装置中的用途:
a)对所述两种或更多种生物标志物进行定量,其中所述两种或更多种生物标志物指示所述患者针对所述癌症的免疫应答的状态,并且在从所述患者获得的肿瘤样品中对每一种生物标志物进行定量;
b)将在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值与从患有所述癌症的患者的参比组对于所述两种或更多种生物标志物中的每一种所获得的值的分布进行比较;
c)对于在步骤a)中对于所述两种或更多种生物标志物所获得的每一个值确定与在步骤a)中获得的值相对应的分布的百分位数;
d)计算所述百分位数的算术平均值或中值;以及
e)将在步骤d)中获得的所述百分位数的算术平均值或中值与百分位数的预定的参比算术平均值或预定的中值进行比较,预定的参比值与对所述抗肿瘤治疗的响应有关;
其中所述两种或更多种生物标志物包括与免疫应答相关的基因的表达。
3.权利要求1或2的用途,其中所述实体癌症是结肠直肠癌、乳腺癌、肺癌、头颈部癌、膀胱癌、卵巢癌或前列腺癌。
4.权利要求3的用途,其中所述实体癌症是结肠直肠癌。
5.权利要求1至4任一项的用途,其中所述两种或更多种生物标志物包括以下一种或多种基因的表达水平:CCR2、CD3D、CD3E、CD3G、CD8A、CXCL10、CXCL11、GZMA、GZMB、GZMK、GZMM、IL15、IRF1、PRF1、STAT1、CD69、ICOS、CXCR3、STAT4、CCL2和TBX21。
6.权利要求1至4任一项的用途,其中所述两种或更多种生物标志物包括以下一种或多种基因的表达水平:GZMH、IFNG、CXCL13、GNLY、LAG3、ITGAE、CCL5、CXCL9、PF4、IL17A、TSLP、REN、IHH、PROM1和VEGFA。
7.权利要求1至4任一项的用途,其中所述两种或更多种生物标志物包括代表人类适应性免疫应答的至少一种基因的表达水平和代表人类免疫抑制应答的至少一种基因的表达水平。
8.权利要求7的用途,其中所述代表人类适应性免疫应答的至少一种基因选自:
CCL5 CCR2 CD247 CD3E CD3G CD8A CX3CL1 CXCL11 GZMA GZMB GZMH GZMK IFNG IL15 IRF1 ITGAE PRF1 STAT1 TBX21
并且所述代表人类免疫抑制应答的至少一种基因选自:
CD274 CTLA4 IHH IL17A PDCD1 PF4 PROM1 REN TIM-3 TSLP VEGF
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