[发明专利]膀胱癌预后生存期标志物的应用、评估装置以及计算机可读取介质

权利要求书

1.用于对标志物进行检测的试剂或装置在用于制备膀胱癌预后生存期的评估试剂中的应用，所述的标志物包括：

淋巴结状态、TOP1基因、MYC基因、CREBBP基因和CDKN2A基因的组合；

所述的淋巴结状态是指淋巴结转移阳性或阴性；检测TOP1基因是指对TOP1基因扩增进行检测；检测MYC基因是指对MYC基因扩增进行检测；检测CREBBP基因是指对CREBBP基突变进行检测；检测CDKN2A基因是指对CDKN2A基因缺失进行检测；

所述的扩增是指：导致了编码蛋白过表达的染色体局部区域基因拷贝数变异；

所述的缺失是指：导致了编码蛋白表达减少的染色体局部区域基因拷贝数变异；

所述的突变是指：单核苷酸变异、插入缺失突变、错义突变、无义突变、剪切突变、移码突变、非移码突变和启动子突变。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，对淋巴结转移进行检测的试剂或装置包括：彩色多普勒超声、CT、磁共振成像、淋巴结穿刺活检用试剂、淋巴结切除活检用试剂中的一种或几种。

3.一种膀胱癌预后评估装置，其特征在于，包括：

淋巴结状态检测装置，用于对淋巴结是否转移进行判断；

测序模块，用于对样本进行测序，获得TOP1基因、MYC基因、CDKN2A基因以及CREBBP基因的数据信息；

判定模块，用于根据淋巴结状态检测装置和测序模块所获得的数据计算评分，评分=（α×LS）+（β×MYC_A）+（γ×TOP1_A）+（δ×CREBBP_T）+（ε×CDKN2A_D）；

LS是指淋巴结是否转移；MYC_A是指MYC基因是否存在扩增；TOP1_A是TOP1基因是否存在扩增；CREBBP_T是指CREBBP基因是否存在突变；CDKN2A_D是CDKN2A是否存在缺失，α、β、γ、δ、ε都是参数，α=1.0723，β=1.3738，γ=1.1620，δ=-1.2486，ε=0.2154；判定条件取“是”时，标志物取值1，取“否”时，标志物取值0；

当评分大于阈值时，认定样本膀胱癌预后较差，阈值是1.07；

所述的扩增是指：导致了编码蛋白过表达的染色体局部区域基因拷贝数变异；

所述的缺失是指：导致了编码蛋白表达减少的染色体局部区域基因拷贝数变异；

所述的突变是指：单核苷酸变异、插入缺失突变、错义突变、无义突变、剪切突变、移码突变、非移码突变和启动子突变。

4.根据权利要求3所述的装置，其特征在于，所述的淋巴结状态检测装置选自彩色多普勒超声、CT、磁共振成像装置中的一种或几种。

5.一种计算机可读取介质，其特征在于，其记载有可以运行以下方法的计算机程序：

步骤1，获得患者淋巴结是否发生转移的信息，以及TOP1、MYC、CREBBP以及CDKN2A基因的变异信息；

步骤2，通过下列公式计算风险评分：

评分=（α×LS）+（β×MYC_A）+（γ×TOP1_A）+（δ×CREBBP_T）+（ε×CDKN2A_D）；

LS是指淋巴结是否转移；MYC_A是指MYC基因是否存在扩增；TOP1_A是TOP1基因是否存在扩增；CREBBP_T是指CREBBP基因是否存在突变；CDKN2A_D是CDKN2A是否存在缺失，α、β、γ、δ、ε都是参数，α=1.0723，β=1.3738，γ=1.1620，δ=-1.2486，ε=0.2154；判定条件取“是”时，标志物取值1，取“否”时，标志物取值0；

步骤3，根据计算得到的评分对膀胱癌患者的预后进行分层，若评分≥阈值则被判定为预后较差，阈值是1.07；

所述的扩增是指：导致了编码蛋白过表达的染色体局部区域基因拷贝数变异；

所述的缺失是指：导致了编码蛋白表达减少的染色体局部区域基因拷贝数变异；

所述的突变是指：单核苷酸变异、插入缺失突变、错义突变、无义突变、剪切突变、移码突变、非移码突变和启动子突变。