[发明专利]一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法及系统

说明书

本发明公开了一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法及系统，该检测方法包括：利用光学图谱技术对待测样本基因组范围内的DNA分子进行荧光标记，荧光标记后进行荧光检测，获得全基因组光学图谱；与正常对照样本数据库进行比对，寻找在光学图谱序列上存在衍生互补的DNA分子，若在光学图谱序列上存在衍生互补的DNA分子，则确定待测样本存在染色体隐匿性相互易位；所述衍生互补的DNA分子表示为在待测样本中检测出存在两条不同衍生的DNA分子，每条衍生的DNA分子中均同时包含了某两条染色体的序列，且序列信息在染色体位置上存在先后互补关系。本发明染色体隐匿性相互易位核型的检测方法简便高效、全面通用、准确。

技术领域

本发明属于染色体遗传诊断和人类辅助生殖领域，具体涉及一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法及系统。

背景技术

染色体相互易位是指两条染色体同时发生一处断裂，并发生错误拼接交换而引起的染色体结构变化，一般没有明显的遗传物质的缺失或增加。染色体相互易位可以根据易位片段大小和易位片段的区带特点，分为肉眼可见的相互易位和隐匿性的相互易位。肉眼可见的相互易位一般易位片段较大且条带特点有一定差异，或者其中一条片段比较大一条比较小，通过普通的细胞染色体核型分析既可明确诊断；但隐匿性的相互易位一般易位片段均较小，或者易位片段的大小和区带特点均很接近，通过常规的细胞染色体核型分析无法明确诊断。染色体相互易位远端部分称为易位片段，剩余包括着丝粒的染色体部分称为中心片段。

染色体相互易位是一种遗传病，可以遗传给后代，肉眼可见的平衡易位在人群中总的发病率约为0.27％，隐匿性的相互易位在人群中的发病率目前不详，但其在反复自然流产夫妇中发病率约在0.73％。染色体相互易位携带者在生育年龄前通常无明显的临床症状，到生育年龄则通常会表现为反复流产、不孕不育或生育发育严重异常的子代。原因在于携带者产生大量不平衡的染色体异常配子，当这些不平衡配子受精后形成的胚胎因为存在染色体异常进而出现种植失败、自然流产及新生儿出生缺陷等，此外女性出现卵巢早衰的风险增加，男性通常会表现出少弱精子症。相比之下，隐匿性的相互易位更容易导致生育发育严重异常的子代，严重威胁人群的生殖健康，是造成新生儿出生缺陷的重要原因。

目前能够检测隐匿性相互易位的技术主要是荧光原位杂交(Fluorescence insitu hybridization，FISH)技术，FISH的原理是依据需检测的目的区域设计出特异寡核苷酸探针，在荧光标记后与胚胎细胞核杂交，在荧光显微镜下观察荧光信号的有无、数量等来定量检测，但应用FISH技术检测隐匿性相互易位需要三个重要的前提：1)夫妇之前生育过染色体不平衡相互易位的异常胎儿的诊断提示，或发生过流产且流产组织为染色体不平衡相互易位的诊断提示；2)需要将患者的外周血细胞预先进性体外培养，获得染色体分裂中期的细胞，然后再进行FISH试验；3)需要有适合病人染色体相互易位的FISH荧光探针，且检测每种不同相互易位需要的探针不同，均需要根据1)中的结果提示个性化定制，不具有通用性；三个条件缺一不可。此外，FISH探针本身也有一定的局限性，如荧光信号容易重叠、信号易分裂等，也可能影响结果的准确性，出现误诊或漏诊的现象。因此，目前FISH技术在诊断隐匿性的相互易位中具有明显的局限性。

此外，近年有研究报道，通过低深度的全基因组测序(Low-pass GenomeSequencing,Low–pass GS)及特定的生物信息学分析也可以检测出隐匿性的染色体平衡易位，由于测序技术本身的局限性导致该方法有一定的漏诊率，当易位断裂点所在位置的碱基序列是高度重复或十分复杂的情况时，则相互易位无法检测出。

综上所述，临床上急需研发探索一种简便高效、全面通用、且能够准确检测染色体隐匿性相互易位的技术方法，用于临床诊断。

发明内容

为了解决现有技术中的不足，本发明旨在提供一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法及系统。

本发明的技术方案具体如下：

本发明第一方面提供一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法，包括如下步骤：