[发明专利]一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法及系统

权利要求书

1.一种染色体隐匿性相互易位核型的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：

(1)提取待测样本的DNA分子；所述待测样本的染色体核型分析结果为正常；

(2)利用光学图谱技术对待测样本基因组范围内的DNA分子进行荧光标记，荧光标记后进行荧光检测，获得全基因组光学图谱；

(3)与正常对照样本数据库进行比对，寻找在光学图谱序列上存在衍生互补的DNA分子，若在光学图谱序列上存在衍生互补的DNA分子，则确定待测样本存在染色体隐匿性相互易位；

所述衍生互补的DNA分子表示：在待测样本中检测出存在两条不同衍生的DNA分子，每条衍生的DNA分子中均同时包含了某两条染色体的序列，且序列信息在染色体位置上存在先后互补关系。

2.根据权利要求1所述的检测方法，其特征在于，所述检测方法还包括，根据衍生互补的DNA分子所包含的两条染色体及序列信息，确定发生隐匿性相互易位的两条染色体、易位断裂点的粗略位置区域、易位方向及易位区带，进而明确隐匿性相互易位染色体的核型。

3.根据权利要求1或2所述的检测方法，其特征在于，所述待测样本选自患者的组织或血液；

优选地，所述待测样本选自患者的外周血。

4.根据权利要求1或2所述的检测方法，其特征在于，所述DNA分子使用Bionano PrepSP Blood and Cell Culture DNA Isolation Kit进行抽提。

5.根据权利要求2所述的检测方法，其特征在于，所述检测方法还包括：通过下述方法1或者方法2进行验证：

方法1：使用长片段聚合酶链式反应和测序技术对权利要求2所获得的易位断裂点的粗略位置区域进行扩增和测序，获得精确到单个碱基水平断裂点位置，验证发生染色体隐匿性相互易位的染色体及染色体断裂点所在的易位区带。

方法2：使用FISH技术对患者的有丝分裂中期细胞样本进行检测，验证发生染色体隐匿性相互易位的染色体及染色体断裂点所在的易位区带。

6.根据权利要求5所述的检测方法，其特征在于，所述长片段聚合酶链式反应的引物以标记点为界确保断裂点在扩增范围内，所述引物的方向为5’到3’；

优选地，所述引物TM值范围为64-68℃，GC％在48-58％，长度在23-28bp；

优选地，所述引物的3’端为G或C；

优选地，所述引物的序列不能有4个以上连续一样的碱基。

7.一种染色体隐匿性相互易位的检测系统，其特征在于，所述系统包含能够处理样本数据的软件和用于承载上述软件的硬件，其特征在于，

1)所述检测系统还包括储存有待测样本和正常对照样本的全基因组光学图谱的硬件；

2)所述软件根据下述规则确定待测样本是否存在染色体隐匿性相互易位：

与正常对照样本数据库进行比对，寻找在光学图谱序列上存在衍生互补的DNA分子，若在光学图谱序列上存在衍生互补的DNA分子，则确定待测样本存在染色体隐匿性相互易位；

所述衍生互补的DNA分子表示：在待测样本中检测出存在两条不同衍生的DNA分子，每条衍生的DNA分子中均同时包含了某两条染色体的序列，且序列信息在染色体位置上存在先后互补关系。

8.根据权利要求7所述的检测系统，其特征在于，所述软件还包括根据下述规则明确隐匿性相互易位染色体的核型：根据确定的衍生互补的DNA分子所包含的两条染色体及序列信息，确定发生隐匿性相互易位的两条染色体、易位断裂点的粗略位置区域、易位方向及易位区带，进而明确隐匿性相互易位染色体的核型。

9.根据权利要求7或8所述的检测系统，其特征在于，所述待测样本的染色体核型分析结果为正常。

10.根据权利要求7或8所述的检测系统，其特征在于，所述待测样本选自患者的组织或血液；

优选地，所述待测样本选自患者的外周血。