[发明专利]在体外侦测样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法在审
| 申请号: | 202210593840.8 | 申请日: | 2018-02-01 |
| 公开(公告)号: | CN115161384A | 公开(公告)日: | 2022-10-11 |
| 发明(设计)人: | 李利;胡家铭;郭广柱 | 申请(专利权)人: | 鉴识生物系统有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6827 | 分类号: | C12Q1/6827;C12Q1/6837;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人: | 贺淑东;武晶晶 |
| 地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 体外 侦测 样本 中的 变异 基因 信息 核酸 微核醣 方法 | ||
1.一种在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于该方法包括下述步骤:
提供生物样本,该生物样本中含有细胞、肿瘤循环细胞和外泌体;和
在体外使用装配具有碱基突出区段的分子信目标分析器测量上述的生物样本和该具有碱基突出区段的分子信标进行交互作用所产生的荧光信号,借此侦测上述生物样本中存在的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸,其中上述的具有碱基突出区段的分子信标是由至少包含9个存在的碱基对的骨干区、至少包含4个碱基的回路、至少包含5个互补碱基的碱基突出区段,该互补碱基是互补于上述的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸、荧光分子基团和荧光淬灭基团所构成,其中上述的碱基突出区段的最后一个互补碱基或上述骨干区的第一个碱基是对应于上述的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的单点突变的碱基。
2.如权利要求1所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的具有碱基突出区段的分子信标是选自下列群组之一及其组合:SEQ ID No 2,SEQ ID No 4,SEQ ID No 5,SEQ ID No 6,SEQ ID No 7,SEQ ID No 9,SEQ ID No11,SEQ ID No 12和SEQ ID No 13。
3.如权利要求2所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的SEQ ID No 4,SEQ ID No 5,SEQ ID No 6或其组合是用于侦测变异的KRAS基因。
4.如权利要求2所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的SEQ ID No 7,SEQ ID No 9或其组合是用于侦测变异的EGFR基因。
5.如权利要求2所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的SEQ ID No 11,SEQ ID No 12或其组合是用于侦测EML4-ALK的基因融合。
6.如权利要求2所述的在体外生物样本中的侦测变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的SEQ ID No 13是用于侦测miR-411微核醣核酸编辑。
7.如权利要求1所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的荧光分子基团包括位置在5’末端的FAM,Cy3和Cy5,和位置接近上述的荧光淬灭基团的内标记荧光分子基团,该内标记荧光分子基团包含iFluorT,iCy3和iCy5。
8.如权利要求1所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的具有碱基突出区段的分子信标是包裹在脂质复合体纳米粒的内层,该脂质复合体纳米粒包括阳离子表面修饰化的脂质复合体纳米粒和可借由抗体捕捉外泌体的脂质复合体纳米粒。
9.如权利要求8所述的在体外侦测生物样本中的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的方法,其特征在于所述的脂质复合体纳米粒是固定在芯片上,上述的芯片所侦测到的目标分子的含量是借由内标准物进行比对计算,上述的内标准物是包裹有信息核醣核酸或微核醣核酸的通用标准囊泡。
10.一种用于侦测变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的生物芯片,其特征在于该生物芯片包含基板和脂质复合体纳米粒,所述的脂质复合体纳米粒固定在该基板上并且包裹具有碱基突出区段的分子信标,该具有碱基突出区段的分子信标是由至少包含9个碱基对的骨干区、至少包含4个碱基的回路、至少包含5个互补碱基的碱基突出区段,该互补碱基是互补于上述的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸、荧光分子基团和位于3’末端的荧光淬灭基团所构成,其中上述的碱基突出区段的最后一个互补碱基或上述的骨干区的第一个碱基是对应于上述的变异的基因、信息核醣核酸或微核醣核酸的单点突变的碱基。
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