[发明专利]一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记、引物组及其应用

权利要求书

1.一组鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记，其特征在于，所述群体种质SNP标记包括：茶树Chr8染色体第119192825位位点为序列表中SEQ ID No.1的第301位核苷酸，和/或茶树Chr15染色体第40853615位位点为序列表中SEQ ID No.2的第301位核苷酸。

2.用于扩增权利要求1所述的鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记的引物组，其特征在于：所述茶树Chr8染色体第119192825位位点通过引物组1核苷酸序列如SEQ ID No.3～5所示扩增鉴定。

3.用于扩增权利要求1所述的鉴定重庆大茶树群体种质SNP标记的引物组，其特征在于：所述茶树Chr15染色体第40853615位位点通过引物组2核苷酸序列如SEQ ID No.6～8所示扩增鉴定。

4.权利要求1所述的SNP标记在鉴定茶树种质是否来源于重庆大茶树群体种质中的应用。

5.根据权利要求4所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用，其特征在于，包括以下步骤：

1)提取茶树材料的DNA；

2)以提取的DNA为模版，利用权利要求2所述的引物组进行PCR扩增反应；

3)获取荧光信号进行基因分型，当茶树Chr8染色体第119192825位位点荧光信号基因分型为CC时是重庆大茶树群体种质来源，TT时为其他来源茶树种质。

6.根据权利要求4所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用，其特征在于，包括以下步骤：

1)提取茶树材料的DNA；

2)以提取的DNA为模版，利用权利要求3所述的引物组进行PCR扩增反应；

3)获取荧光信号进行基因分型，当茶树材料Chr15染色体第40853615位位点荧光信号基因分型为TT时是重庆大茶树群体种质来源，CC时为其他来源茶树种质。

7.根据权利要求4所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用，其特征在于，包括以下步骤：

1)提取茶树材料的DNA；

2)以提取的DNA为模版，利用权利要求2和权利要求3所述的引物组进行PCR扩增反应；

3)获取荧光信号进行基因分型，当茶树Chr8染色体第119192825位位点荧光信号基因分型为CC时是重庆大茶树群体种质来源，TT时为其他来源茶树种质；并且当茶树材料Chr15染色体第40853615位位点荧光信号基因分型为TT时是重庆大茶树群体种质来源，CC时为其他来源茶树种质。

8.根据权利要求5、6、7所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用，其特征在于，所述步骤2)中PCR的总反应体积为10μL，包括2.5μL DNA、5μL GUDE FLu-Arms 2x PCRMix、0.5μL混合引物和2μL水。

9.根据权利要求5、6、7所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用，其特征在于，所述步骤2)PCR扩增反应条件如下：95℃10min；95℃20s，61-55℃1min 10个循环；95℃20s，55℃1min，28-45个循环；25℃30s。

10.根据权利要求5、6、7所述SNP标记在鉴定重庆大茶树群体种质中的应用，其特征在于，所述步骤2)PCR扩增反应在CFX Connect^TM Real-Time System仪器上进行。