[发明专利]一种小麦2A染色体特异细胞学探针及其应用

说明书

本发明属于分子遗传领域，具体涉及一种小麦2A染色体特异细胞学探针及其应用。具体技术方案为：一种探针，所述探针的核酸序列如SEQ IN NO.1所示。本发明提出了一种全新的小麦2A染色体特异探针DNA，针对性和特异性极强，可为后续小麦2A染色体的高纯度流式分选提供坚实的理论基础和技术保证。

技术领域

本发明属于分子遗传领域，具体涉及一种小麦2A染色体特异细胞学探针及其应用。

背景技术

小麦是世界上第一大粮食作物，在我国也是仅次于水稻的第二大粮食作物。小麦为异源六倍体作物(基因组为AABBDD)，基因组巨大(约为17G)且重复序列多，结构复杂。因此，对小麦进行基因组测序成本非常高，且在重复序列丰富区域常常不能正确组装。单染色相较于整个基因组而言，数据量小(常为数百兆)，因此测序成本低。而且，对单染色体测序，可有效避免其他染色体的干扰，组装准确度更高。因此，单染色体测序对于小麦而言具有重要意义。

但是，准确分选出需要测序的目标染色体是进行单染色体测序的前提。单染色体分选可基于染色体大小和荧光标记强度两种方式进行。对于小麦而言，由于A、B、D组内染色体大小差异较小，直接按染色体大小进行分选难以获得高纯度目标染色体，从而无法进行后续的单染色体测序。如果开发单染色体特异探针，则可使目标染色体携带特异的荧光信号，从而达到高纯度分选的目的。但目前尚未出现任何关于小麦2A染色体特异探针的相关报告。

发明内容

本发明的目的是提供一种小麦2A染色体特异细胞学探针及其应用。

为实现上述发明目的，本发明所采用的技术方案是：一种探针，所述探针的核酸序列如SEQ IN NO.1所示。

相应的，一种探针，所述探针的核酸序列如SEQ IN NO.1所示，所述探针上连接有荧光基团。

优选的，所述探针的3’端和/或5’端和/或第27号胸腺嘧啶上连接有荧光基团。

相应的，所述探针在小麦选育中的应用。

相应的，所述探针在小麦基因测序中的应用。

相应的，所述探针在小麦高纯度分选中的应用。

相应的，所述探针在小麦单染色体测序中的应用。

优选的，利用权利要求1所述探针对小麦细胞进行杂交。

优选的，所述杂交使用的杂交缓冲液为：利用柠檬酸钠缓冲液和TE缓冲液对探针粉末稀释后获得。

优选的，柠檬酸钠缓冲液和TE缓冲液的体积比为1:1。

相应的，利用所述探针制备的试纸、试剂、试剂盒。

相应的，包含所述探针制备的试纸、试剂、试剂盒。

本发明具有以下有益效果：本发明提出了一种全新的小麦2A染色体特异探针DNA，针对性和特异性极强。本发明还进一步提出的荧光基团连接方式进行连接荧光基团，可使该探针信号显著放大，为后续小麦2A染色体的高纯度流式分选提供坚实的理论基础和技术保证。

附图说明

图1为以Oligo-2A(仅在5’端连接荧光基团FAM)为探针，曝光时间2.8秒的荧光原位杂交图的荧光原位杂交图；

图2为以Oligo-pSc119.2和Oligo-pTa535为探针在图1相同的染色体分裂相上进行杂交的荧光原位杂交图；

图3为以Oligo-2A^plus(在5’端、3’端和第27位碱基——胸腺嘧啶上连接荧光基团FAM)为探针，曝光时间2.8秒的荧光原位杂交图；

图4为以Oligo-pSc119.2和Oligo-pTa535为探针在图3相同的染色体分裂相上进行杂交的荧光原位杂交图。