[发明专利]外泌体miRNA-485-3p和miRNA-885-5p作为肝癌诊断标志物的应用在审
申请号: | 202210418007.X | 申请日: | 2022-04-20 |
公开(公告)号: | CN114657251A | 公开(公告)日: | 2022-06-24 |
发明(设计)人: | 李伟华;陈德喜;李传云;李榕;陈静;罗淑敏 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学附属北京佑安医院;北京市肝病研究所 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/113;C12N15/10 |
代理公司: | 北京华科联合专利事务所(普通合伙) 11130 | 代理人: | 王为 |
地址: | 100069 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 外泌体 mirna 485 885 作为 肝癌 诊断 标志 应用 | ||
1.用于诊断早期肝癌的外泌体为miRNA-485-3p和/或miRNA-885-5p。
2.根据权利要求1所述的外泌体,其特征在于,
miRNA-485-3p的序列为5’-AGAGAGGAGAGCCGUGUAUGAC-3’;
miRNA-885-5p的序列为5’-UCCAUUACACUACCCUGCCUCU-3’。
3.权利要求1所述的外泌体miRNA-485-3p和/或miRNA-885-5p在诊断肝癌方面的应用。
4.权利要求1所述的外泌体miRNA-485-3p和/或miRNA-885-5p在诊断早期肝癌方面的应用。
5.权利要求1所述的外泌体miRNA-485-3p和/或miRNA-885-5p作为肿瘤标记物在诊断早期肝癌方面的应用。
6.权利要求1所述的外泌体miRNA-485-3p和/或miRNA-885-5p在制备早期肝癌诊断标记物的产品中的应用。
7.权利要求1所述的外泌体miRNA-485-3p和/或miRNA-885-5p在制备肝癌诊断试剂盒中的应用。
8.根据权利要求权利要求7所述的应用,其特征在于,所述肝癌为早期肝癌。
9.权利要求1所述的外泌体的制备方法,主要包括以下3个部分:
1)分离血浆中的外泌体;
2)提取外泌体中miRNA;
3)荧光定量PCR反应检测miRNA。
10.根据权利要求5或6所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:
1)血浆样品的制备
在采血管中加入EDTA抗凝剂,采集完血液后,将采血管缓慢颠倒混匀,混匀的全血4℃1,000-2,000×g离心5-10min,上层黄色半透明液体即为待收集的血浆,吸出血浆时贴着页面逐渐往下吸,切勿吸出细胞成分;收集到的血浆可直接用于后续实验或分装好-80℃冰箱保存,
2)外泌体的提取
将血浆室温,2,000×g离心20min,去除残留细胞及碎片;转移上清到新的离心管中,注意不要吸到底部沉淀;室温,10,000×g离心20min,去除残留碎片;用移液器转移上清到新的离心管中,1ml血浆样品,加入500ul 1×PBS及300ulVEX Exosome Isolation Reagent溶液,混匀后将混合液竖直放于2-8℃静置30min进行孵育,室温10,000×g离心5min去上清,然后室温10,000×g离心30s,用移液器吸除残留液体,血浆外泌体即存在于管底部沉淀中,
3)外泌体miRNA的提取
外泌体miRNA提取使用试剂盒,主要操作步骤如下:①取外泌体,加入1ml Trizol充分匀浆,振荡器振荡或移液器吸打数次混匀,室温静置5min,使得核酸蛋白复合物完全分离,②4℃12,000rpm(13,400×g)离心5min,取上清,转入一个新的无RNase的离心管中,③加入200μl氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15sec,室温放置5min,④4℃12,000rpm(13,400×g)离心15min,样品会分成三层:黄色的有机相,中间层和无色的水相,RNA主要在水相中,水相的体积约为所用裂解液MZ试剂的50%,把水相转移到新管中,进行下一步操作,⑤量取转移液的体积,缓慢加入转移液体积0.43倍的无水乙醇,混匀,将得到的溶液和沉淀一起转入向吸附柱miRspin中,室温12,000rpm(13,400×g)离心30sec,若一次不能将全部溶液和混合物加入向吸附柱miRspin中,请分两次转入,离心后弃掉向吸附柱miRspin,保留流出液,⑥量取流出液的体积,缓慢加入流出液体积0.75倍的无水乙醇,混匀,将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱miRelute中,室温12,000rpm(13,400×g)离心30sec,⑦向吸附柱miRelute中加入500μl去蛋白液MRD,室温静置2min,室温12,000rpm(13,400×g)离心30sec,弃废液,⑧向吸附柱miRelute中加入500μl漂洗液RW,室温静置2min,室温12,000rpm(13,400×g)离心30sec,弃废液,⑨重复操作步骤7,⑩将吸附柱miRelute放入2ml收集管中,室温12,000rpm(13,400×g)离心1min,去除残余液体,将吸附柱miRelute转入一个新的RNase-Free 1.5ml离心管中,加15μl RNase-FreeddH2O,室温放置2min,室温12,000rpm(13,400×g)离心2min,
4)cDNA合成
取20ngRNA,基于ReverTra Ace qPCR RT Kit:FSQ-101,TOYOBO逆转录试剂盒进行,加入2ul 5×RT Buffer,0.5ul Primer Mix,0.5ul RT Enzyme Mix,加无酶水至10ul总体系,37℃条件下,进行15min的逆转录反应→在98℃条件下,进行5min的酶失活反应→反应结束后,取部分进行10×浓度稀释,每一个miRNA都要一条特异的反转录引物,所以每一个miRNA的反转录反应都是独立进行的,
5)cDNA产物进行荧光定量PCR反应
按照RR820A takaraPremix Ex TaqTMII相应不走进行,所有反应均做3个复孔,10ulPremix,上下游引物各0.5ul,1ul模板样品,灭菌水8ul,共计20ul反应体系,PCR反应条件为50℃,2min,95℃,10min;95℃,1min;95℃,15s,60℃,30s,40个循环,终点采集荧光,通过该反应可以得到各个miRNA在不同样本中的表达量,进而进行后续分析,
6)数据分析
荧光定量PCR检测miRNA相对表达量,最终结果以2-△△Ct分析,采用专业作图软件Graphpad Prism7进行作图并统计分析,P<0.05时,有显著性差异,分析内容为miRNA在早期肝癌患者、慢性HBV患者和健康人群中表达的个体差异分析。
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