[发明专利]一种基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法在审
申请号: | 202210332874.1 | 申请日: | 2022-03-31 |
公开(公告)号: | CN114891860A | 公开(公告)日: | 2022-08-12 |
发明(设计)人: | 张贝贝;李苗;王艳歌;杜恩明;魏圆梦;王娇娇;宋宗明 | 申请(专利权)人: | 河南省人民医院;河南省立眼科医院(河南省眼科研究所) |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 杜静 |
地址: | 450000 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr hrca 技术 可视化 dna 检测 方法 | ||
1.一种基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)用Cas9/sgRNA特异性识别和切割靶DNA;
(2)将切割产物连接成环状DNA;
(3)通过HRCA反应对环状DNA进行扩增、检测。
2.根据权利要求1所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(2)反应体系为每μL反应液中包含:0.2~0.5μL的切割产物、0.2~0.5U的T4 DNA连接酶、0.1~0.2μLT4 DNA连接酶缓冲液,余量为无RNase的H2O。
3.根据权利要求1所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(2)反应温度为20~25℃。
4.根据权利要求3所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(2)反应孵育时间为8~12分钟。
5.根据权利要求1所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(3)通过HRCA反应对环状DNA进行扩增时添加一对与环状DNA双链分别互补的引物。
6.根据权利要求1所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(3)的反应体系为为每μL反应液中包含:0.03~0.04μL环状DNA、0.06~0.08μL与环状DNA双链分别互补的引物对、0.03~0.04μLdNTP、0.05~0.15μLThermoPol缓冲液、0.015~0.02μL Bst DNA聚合酶,余量为无RNase的H2O。
7.根据权利要求1所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(3)的反应体系中的Bst DNA聚合酶单独加入,在加入前先进行孵育,加入后再进行反应孵育。
8.根据权利要求7所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(3)在加入Bst DNA聚合酶前在90~96℃下孵育8~12分钟。
9.根据权利要求7所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(3)加入Bst DNA聚合酶后55~65℃下孵育50~70分钟。
10.根据权利要求1所述的基于CRISPR和HRCA技术的可视化靶DNA检测方法,其特征在于,步骤(3)检测具体为将HRCA扩增产物加入SYBR Green I染料混合,进行可视化检测。
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