[发明专利]一种对分裂位点进行筛选的方法及其应用

权利要求书

1.一种对分裂位点进行筛选的方法，其包括步骤：

S1、数据库建立：使用计算机语言编写程序，预测内含肽在氨基酸序列中的每相邻的两个氨基酸残基中嵌入后都发生了剪接反应将自身切除，相邻肽段相连后形成的氨基酸序列组成蛋白数据库；

S2、实验进行：在基因片段中通过分子克隆实验方法插入内含肽序列，翻译后得到肽段，将该肽段通过质谱检测是否含有标记氨基酸序列，并与所述蛋白数据库进行比对，实现对断裂位点的证实。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤S1的数据库建立包括：

S11、按顺序合并基因片段1、插入内含肽序列片段和基因片段2，得到新DNA序列；

S12、将所述新DNA序列翻译为新氨基酸序列；

S13、搜索所述新氨基酸序列中的目标内含肽氨基酸序列，删除所述目标内含肽氨基酸序列，得到输出氨基酸序列；

S14、预测将所述插入内含肽序列片段插入到基因片段1和基因片段2每个可能的位点，再重复步骤S11～S13，得到的所有所述输出氨基酸序列构成所述蛋白数据数据库。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，步骤S11中，在所述插入内含肽序列片段中插入若干个碱基，优选插入1个碱基。

4.一种如权利要求1-3中任一项所述方法在分裂位点筛选中的应用，尤其是实现对大肠杆菌抗原蛋白Im7-6和/或Cas9蛋白分裂位点筛选的应用。