[发明专利]一种冠状病毒RBDdm变异体及其应用

说明书

本发明涉及一种用含有RBDdm变异体蛋白预防新型冠状病毒及其变异体的疫苗的方法；以及(1)其序列选自：(c1)SEQ ID NO：2；(c2)与(c1)80％以上同源、且所编码的蛋白质与冠状病毒刺突糖蛋白RBD变异体蛋白质80％以上同源的核酸序列；以及(c3)(c1)或(c2)的截短体；或者(2)其序列选自选自：(d1)SEQ ID NO：4；(d2)与(d1)80％以上同源、且所编码的蛋白质与冠状病毒刺突糖蛋白RBD变异体蛋白质80％以上同源的核酸序列；以及(d3)(d1)或(d2)的截短体。利用本申请RBD变异体蛋白制备的疫苗可以预防冠状病毒引起的疾病，具有广谱预防新型冠状病毒引起的疾病的潜力，且制备方法简单，利于进行新型冠状病毒疫苗的大规模生产，具有良好的应用前景。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，特别地涉及一种冠状病毒RBD变异体及其应用。

背景技术

新型冠状病毒SARS-CoV-2已在全球上百个国家和地区传播，截止到2022年1月12日，已导致超过3.1亿人感染，造成超过550万人死亡。SARS-CoV-2病毒侵入人体细胞后会快速复制。然而因其为单链RNA病毒，复制时出错率高，冠状病毒宿主的广泛性以及其自身的基因组结构，使得SARS-CoV-2极易发生基因突变以及基因重组。

自2020年初爆发新冠肺炎疫情以来，全球各地出现了多种新冠病毒变异株，部分变异株展现出了传播力增强的特性。2020年12月下旬，英国根据样本的全基因组测序报告了一种新的SARS-CoV-2变异，即Alpha(B.1.1.7谱系)变体。Alpha变体包括病毒基因组中的17个突变，其中，刺突蛋白(S蛋白)中有8个突变(Δ69-70缺失、Δ144缺失、N501Y、A570D、P681H、T716I、S982A、D1118H)。

2020年10月在南非发现了一种具有多个刺突蛋白突变的SARS-CoV-2谱系的新变种Beta,(即B.1.351谱系或501Y.V2)，导致第二波COVID-19感染。Beta变体在刺突蛋白中包含9个突变(L18F、D80A、D215G、R246I、K417N、E484K、N501Y、D614G和A701V)，其中3个突变(K417N、E484K和N501Y)位于RBD中，并增加对ACE2受体的结合亲和力。

B.1.1.28变种，也称为501Y.V3或Gamma谱系变体，于2020年12月在巴西被发现，并于2021年1月在美国首次被发现。Gamma变体在刺突蛋白中包含10个突变(L18F、T20N、P26S、D138Y、R190S、H655Y、T1027IV1176、K417T、E484K和N501Y)，其中三个突变(L18F、K417N、E484K)位于RBD中，类似于Beta(B.1.351)变体。

2020年10月在印度首次被发现，目前已在多个国家均检测到感染的变异株B.1.617已经进一步演化出三个不同突变：B.1.617.1、B.1.617.2(Delta)和B.1.617.3。

最先在非洲博茨瓦纳发现的新型冠状病毒变异株Omicron(B.1.1.529)，随后在南非引发大面积感染。Omicron变异株已在国际上传播，并导致病例数量迅速增加，特别是在南非。Omicron变异株在刺突蛋白上含32个突变位点，其中位于RBD区的突变有15个，分别是G339D、S371L、S373P、S375F、K417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484A、Q493K、G496S、Q498R、N501Y、Y505H。

冠状病毒刺突蛋白的突变和碱基缺失，使得SARS-CoV-2表现出丰富的遗传多样性。根据已有的被世卫组织(WHO)列入值得关注的变异株(VOC)变种，已证明了SARS-CoV-2的突变可导致其的传染性增加、毒性增加或者临床表现改变，甚至一些变异株可发生免疫逃逸，使得疫苗或特异性抗体对机体保护能力下降。