[发明专利]用于检测鼻疽诺卡菌的LAMP引物组和检测试剂盒有效
申请号: | 202210292620.1 | 申请日: | 2022-03-24 |
公开(公告)号: | CN114381538B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 李振军;邱小彤;徐帅 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/6804;C12N15/11;C12R1/365 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 黄爽 |
地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 鼻疽 诺卡菌 lamp 引物 试剂盒 | ||
1.用于检测鼻疽诺卡菌的LAMP引物组,其特征在于,所述LAMP引物组为:
外侧正向引物F3:5’- GCGGTGAGCAGTGACGT -3’;
外侧反向引物B3:5’- ACCCGGCACCAGGAGT -3’;
内侧正向引物FIP:5’- CCATGTCGTAGGCGACCAGCTCGCCACCATGCGGAAAC -3’;
内侧反向引物BIP:5’- AGTGTGCGCGACGAACAACCGGCGCCATGGTGGGGTT -3’;
环引物LF:5’- GAGACCGCGTTGTCCCC -3’;
环引物LB:5’- ACGCTGACGATGGCACT -3’。
2.基于CRISPR-Cas12a技术的鼻疽诺卡菌核酸检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的LAMP引物组、crRNA、Cas12a蛋白、荧光基团和荧光淬灭基团双标记的单链DNA探针;且在LAMP引物组的引物FIP或BIP中引入PAM位点;或者,
所述试剂盒包含权利要求1所述的LAMP引物组、crRNA、Cas12a蛋白、荧光基团和生物素双标记的单链DNA探针;且在LAMP引物组的引物FIP或BIP中引入PAM位点;
其中,crRNA的序列为:5’- UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUUCGCCACCAUGCGGAAACGGCU -3’;
单链DNA探针的序列为:5’- TTTATTTATTT -3’。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,引入PAM位点的引物FIP的核苷酸序列为:5’- CCATGTCGTAGGCGACCAGCTCGCCACCATGCGGAAAC-3’。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于,在单链DNA探针的5’端修饰6-FAM或FITC基团,3’端修饰BHQ1;或者,
在单链DNA探针的5’端修饰6-FAM或FITC基团,3’端修饰生物素。
5.基于CRISPR-Cas12a技术的鼻疽诺卡菌核酸检测方法,其特征在于,所述方法为非疾病诊断目的,包括以下步骤:
1)提取待测样品中的DNA;
2)以步骤1)中提取的DNA为模板,利用权利要求2-4任一项所述试剂盒中的LAMP引物组进行LAMP扩增反应;
3)将步骤2)的扩增产物与反应缓冲液、crRNA和Cas12a蛋白形成的复合物以及荧光基团和荧光淬灭基团双标记的单链DNA探针混合,反应一段时间后进行荧光强度检测。
6.基于CRISPR-Cas12a和侧流层析技术的鼻疽诺卡菌核酸检测方法,所述方法为非疾病诊断目的,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测样品中的DNA;
2)以步骤1)中提取的DNA为模板,利用权利要求2-4任一项所述试剂盒中的LAMP引物组进行LAMP扩增反应;
3)将步骤2)的扩增产物与反应缓冲液、crRNA和Cas12a蛋白形成的复合物以及荧光基团和生物素双标记的单链DNA探针混合,反应一段时间后,将反应产物加到侧流层析检测试纸条上,并滴加2~3滴运行缓冲液,使反应产物在毛细管作用下沿试纸条流动,2分钟内观察显色结果。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述侧流层析检测试纸条由样品垫、结合垫、硝酸纤维素膜和吸收垫组成;
其中,结合垫包被有链霉亲和素修饰的纳米金颗粒;
硝酸纤维素膜上设有检测线和质控线,检测线包被有生物素化牛血清白蛋白,质控线包被有抗羧基荧光素抗体或抗异硫氰酸荧光素抗体。
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