[发明专利]GPR33基因在马尔尼菲篮状菌易感人群评估的应用有效

专利信息
申请号: 202210256670.4 申请日: 2022-03-16
公开(公告)号: CN114657242B 公开(公告)日: 2022-11-11
发明(设计)人: 李征途;叶枫;邱晔;李少强;占扬清;李永明;杨璟璐 申请(专利权)人: 广州医科大学附属第一医院;广州呼吸健康研究院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B20/00;G16H10/20
代理公司: 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 代理人: 曹爱红
地址: 510120 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: gpr33 基因 马尔尼菲篮状菌易 感人 评估 应用
【说明书】:

发明涉及一种生物样本中GPR33基因作为生物标志物在开发和/或制备评估马尔尼菲篮状菌易感人群的产品中的应用,涉及生物技术和医学技术领域。本发明提供了一种生物样本中GPR33基因作为生物标志物在开发和/或制备评估马尔尼菲篮状菌易感人群的产品中的应用,为HIV阴性马尔尼菲篮状菌的易感人群的评估提供生物标志物。

技术领域

本发明涉及生物技术和医学技术领域,特别是涉及GPR33基因在马尔尼菲篮状菌易感人群评估的应用。

背景技术

马尔尼菲篮状菌感染是一种严重威胁患者生命的地方性致病真菌病,其易感人群逐渐由HIV阳性向HIV阴性患者转移,并且在HIV阴性肺部真菌感染中发病率上升最快,然而HIV阴性马尔尼菲篮状菌感染的易感因素和发病机制上不明确,常被误诊、漏诊,死亡率和复发率均较高。了解其发病机制是快速诊断和有效治疗该疾病的关键。

马尔尼菲篮状菌病常见于一些细胞免疫存在缺陷的患者。近些年来,越来越多的潜在免疫缺陷被发现与马尔尼菲篮状菌的易感性相关,其中基因突变导致的免疫缺陷较为显著,包括STAT1,CARD9,STAT3等基因突变。

发明内容

针对上述问题,本发明提供一种生物样本中GPR33基因作为生物标志物在开发和/或制备评估马尔尼菲篮状菌易感人群的产品中的应用,为HIV阴性马尔尼菲篮状菌的易感人群的评估提供生物标志物。

为了达到上述目的,本发明提供一种生物样本中GPR33基因作为生物标志物在开发和/或制备评估马尔尼菲篮状菌易感人群的产品中的应用。

本发明人在研究过程中发现,马尔尼菲篮状菌病患者体内的GPR33基因上的停止增益变体c.C418T可能导致蛋白质翻译提前终止并改变蛋白质的3D结构,因此可以通过检测生物样本中GPR33基因的序列,来判断提供生物样本的人员是否为马尔尼菲篮状菌的易感人群。

在其中一个实施例中,所述生物标志物为GPR33基因c.C418T突变。

本发明还提供了一种用于评估马尔尼菲篮状菌易感人群的产品,该产品包括:用于检测生物样本中GPR33基因的试剂。

在其中一个实施例中,所述用于检测生物样本中GPR33基因的试剂包括:提取生物样本中核酸的试剂、PCR扩增试剂、PCR产物纯化试剂和PCR产物测序试剂。

在其中一个实施例中,所述产品采用以下引物对进行PCR扩增:

rs1047034-F:GTCTGGTTGATATGGGAGT(SEQ ID NO:1);

rs1047034-R:CAAGGCAGTGATCTGTTTC(SEQ ID NO:2);

rs1292324632-F:GCCTTCCTCTTCTCCATCGA(SEQ ID NO:3);

rs1292324632-R:GCTGGCCTCGTCAATTTCAT(SEQ ID NO:4);

rs17097921-F:AAGTCACCTTTCCTTTACG(SEQ ID NO:5);

rs17097921-R:TATGGGTGCTAAGATTCAA(SEQ ID NO:6);

rs62011763-F:TCTCCATGAGCCTCAGTGTC(SEQ ID NO:7);

rs62011763-R:GCCGCCTCTCCTGTTTTAAC(SEQ ID NO:8);

rs62011763-NF:GGAAAGAGGTCTGTGCCA(SEQ ID NO:9);

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