[发明专利]一种矮型且四季常绿苦草品系的鉴定方法

说明书

本发明植物分子标记领域，特别是涉及一种苦草的鉴定方法，所述鉴定方法包括用能够特异性识别苦草SNP标记的引物组或试剂盒检测苦草的SNP标记。本发明的苦草鉴定相关SNP标记填补苦草SNP分子标记开发的技术空白，可实现高通量操作，具有很高的准确性，数据读取简单，节约成本，提高效率，为快速鉴定和评价各苦草亚种亲缘关系提供了科学依据，为建立苦草分子辅助育种技术平台提供理论和数据支持，为选育优质苦草品种提供高效检测方法；为评价我国苦草品种遗传特征、特定苦草品种鉴定等工作提供理论依据和技术手段，具有较为重要的理论价值和应用意义。

技术领域

本申请是2020年11月17日提交的、申请号为2020112899748、名称为：“苦草鉴定相关SNP标记及其用途”的中国发明专利申请的分案申请。本发明涉及植物分子标记领域，特别是涉及一种苦草的鉴定方法。

背景技术

苦草(Vallisneria)，俗称“扁担草”“水韭菜”，隶属于被子植物门(Angiospermae)，单子叶植物纲(Monocots)，沼生目(Helobiae)，水鳖科(Hydrocharitaceae)，多年生无茎沉水草本植物，有匍匐茎，叶呈线形或带形，生长在溪沟、河流等环境中，广泛分布于世界各地，是淡水生态系统的建群物种和重要组成部分。苦草吸附悬浮污染物能力强，具备氮、磷去除能力，能有效缓解水体富营养化程度，有效地抑制藻类的繁殖生长，还能为后续其他水生植物的生长提供保障，使其成为水质净化、水域生态修复的先锋物种，太和水公司选育的矮型苦草，因其矮型化、四季常绿、耐污染、耐弱光等特点，其根茎叶发达、光合作用强，可产生大量的原生氧，能够高效吸收、转化氮磷等营养盐，适用于我国各种水体。同时配置各种高低不同、形态各异、色泽有别的水下草坪和水下森林，在满足水下生态物种多样性的同时，构建优美的水下景观，在水域生态修复工程中得到广泛应用。近年来，工程上应用的苦草种类繁多，命名和分类混乱，由于苦草形态受环境及主观因素影响较大，形态学鉴定结果可靠性较低，加之形态鉴定方法周期长，因此，开发用于区分不同苦草亚种的分子标记十分必要。

SNP标记(single nucleotide polymorphism marker)是分子标记中在当前遗传标记开发中研究最多、最热，也是应用前景最广的分子标记，利用SNP标记可以快速准确的鉴定不同苦草亚种，国内对于苦草SNP标记开发方法还未见报道。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点，本发明的目的在于提供一种苦草的鉴定方法，用于解决现有技术中的问题。

为实现上述目的及其他相关目的，本发明提供一组苦草鉴定相关的SNP标记，所述SNP标记包括第一SNP标记至第二十二SNP标记中的一个或几个。

一组用于苦草鉴定的引物组，所述引物组包括用于检测第一SNP标记至第二十二SNP标记的引物对。

一种用于苦草鉴定的试剂盒，所述试剂盒包括所述的引物组。

所述的SNP标记、所述的引物组或所述的试剂盒在苦草品系鉴定、建立苦草分子辅助育种技术平台、选育优质苦草品系以及评价苦草品系遗传特征中的用途。

一种苦草的鉴定方法，所述鉴定方法包括用能够特异性识别苦草SNP标记的引物组或试剂盒检测苦草的SNP标记。

优选的，所述试剂盒中包括所述能够特异性识别苦草SNP标记的引物组。

优选的，所述引物组包括SEQ ID NO.23～SEQ ID NO.66所示的引物对。

更优选的，所述试剂盒还包括用于从样品中提取基因组DNA的试剂、利用所述引物组进行PCR反应的试剂。

优选的，所述苦草的SNP标记包括第一SNP标记至第二十二SNP标记中的一种或几种。

优选的，所述鉴定方法包括以下步骤：

1)用所述引物组以待测苦草的基因组DNA为模板进行PCR扩增；