[发明专利]基于脱氧核糖核酶的去甲基化酶活性检测方法和应用在审

专利信息
申请号: 202210096320.6 申请日: 2022-01-26
公开(公告)号: CN114606295A 公开(公告)日: 2022-06-10
发明(设计)人: 蒋健晖;贺建军;黄娟;唐丽娟 申请(专利权)人: 湖南大学
主分类号: C12Q1/682 分类号: C12Q1/682;C12Q1/26;G01N21/64
代理公司: 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 代理人: 陈晖
地址: 410082 湖*** 国省代码: 湖南;43
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 基于 脱氧 核糖 甲基化酶 活性 检测 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种基于脱氧核糖核酶的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、在I-R3 DNAzyme催化核心区引入甲基残基获得甲基化的DNAzyme;将所述甲基化的DNAzyme与Substrate退火杂交,然后与去甲基化酶共孵育以去除DNAzyme上的甲基,恢复切割活性;

S2、加入锌离子形成DNAzyme切割反应体系,切割所述Substrate的特定位点,释放出可靶向Cas12a-crRNA的序列;

S3、加入含有非特异性单链的Cas12a报告溶液,所述可靶向Cas12a-crRNA的序列靶向激活Cas12a,从而切割所述非特异性单链,获得荧光信号,通过监测荧光信号的变化达到检测去甲基化酶活性的目的。

2.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S1中所述引入甲基残基包括O6MeG、m6A、1MeA、3MeC中的一种或多种。

3.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S1中所述去甲基化酶为MGMT、ALKBH2、FTO中的一种或多种;所述DNAzyme为DNAzyme1~DNAzyme8,DNAzyme1.1-4.1中的一种,所述Substrate为Substrate1~Substrate3中的一种;

所述DNAzyme1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;

所述DNAzyme2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;

所述DNAzyme3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;

所述DNAzyme4的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;

所述DNAzyme5的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;

所述DNAzyme1.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.6所示;

所述DNAzyme2.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.7所示;

所述DNAzyme3.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.8所示;

所述DNAzyme4.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.9所示;

所述DNAzyme6的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;

所述DNAzyme7的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;

所述DNAzyme8的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;

所述Substrate1的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;

所述Substrate2的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示;

所述Substrate3的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示。

4.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S3中所述非特异性单链为携带有荧光基团和淬灭基团的ssDNA,所述ssDNA的序列如SEQ ID NO.17所示。

5.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述Cas12a报告溶液包括crRNA和Cas12a,所述crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示。

6.根据权利要求5所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述Cas12a报告溶液的成分还包括:50mM HEPES、100mM NaCl、20mM MgCl2,pH 7.4。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S1具体为:

S1-1、将DNAzyme与Substrate混合于去甲基化反应的缓冲体系中,置于95℃反应5min;

S1-2、加入去甲基化酶或细胞裂解液,37℃过夜反应。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于湖南大学,未经湖南大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202210096320.6/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top