[发明专利]基于脱氧核糖核酶的去甲基化酶活性检测方法和应用在审
| 申请号: | 202210096320.6 | 申请日: | 2022-01-26 |
| 公开(公告)号: | CN114606295A | 公开(公告)日: | 2022-06-10 |
| 发明(设计)人: | 蒋健晖;贺建军;黄娟;唐丽娟 | 申请(专利权)人: | 湖南大学 |
| 主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/26;G01N21/64 |
| 代理公司: | 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 | 代理人: | 陈晖 |
| 地址: | 410082 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 脱氧 核糖 甲基化酶 活性 检测 方法 应用 | ||
1.一种基于脱氧核糖核酶的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、在I-R3 DNAzyme催化核心区引入甲基残基获得甲基化的DNAzyme;将所述甲基化的DNAzyme与Substrate退火杂交,然后与去甲基化酶共孵育以去除DNAzyme上的甲基,恢复切割活性;
S2、加入锌离子形成DNAzyme切割反应体系,切割所述Substrate的特定位点,释放出可靶向Cas12a-crRNA的序列;
S3、加入含有非特异性单链的Cas12a报告溶液,所述可靶向Cas12a-crRNA的序列靶向激活Cas12a,从而切割所述非特异性单链,获得荧光信号,通过监测荧光信号的变化达到检测去甲基化酶活性的目的。
2.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S1中所述引入甲基残基包括O6MeG、m6A、1MeA、3MeC中的一种或多种。
3.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S1中所述去甲基化酶为MGMT、ALKBH2、FTO中的一种或多种;所述DNAzyme为DNAzyme1~DNAzyme8,DNAzyme1.1-4.1中的一种,所述Substrate为Substrate1~Substrate3中的一种;
所述DNAzyme1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述DNAzyme2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
所述DNAzyme3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
所述DNAzyme4的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
所述DNAzyme5的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
所述DNAzyme1.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.6所示;
所述DNAzyme2.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.7所示;
所述DNAzyme3.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.8所示;
所述DNAzyme4.1的核苷酸序列入SEQ ID NO.9所示;
所述DNAzyme6的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;
所述DNAzyme7的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;
所述DNAzyme8的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;
所述Substrate1的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;
所述Substrate2的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示;
所述Substrate3的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示。
4.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S3中所述非特异性单链为携带有荧光基团和淬灭基团的ssDNA,所述ssDNA的序列如SEQ ID NO.17所示。
5.根据权利要求1所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述Cas12a报告溶液包括crRNA和Cas12a,所述crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示。
6.根据权利要求5所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述Cas12a报告溶液的成分还包括:50mM HEPES、100mM NaCl、20mM MgCl2,pH 7.4。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的去甲基化酶活性检测方法,其特征在于,所述S1具体为:
S1-1、将DNAzyme与Substrate混合于去甲基化反应的缓冲体系中,置于95℃反应5min;
S1-2、加入去甲基化酶或细胞裂解液,37℃过夜反应。
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