[发明专利]用于胰腺癌筛查的标志物、探针组合物及其应用在审
申请号: | 202210081938.5 | 申请日: | 2022-01-24 |
公开(公告)号: | CN114369664A | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
发明(设计)人: | 王小奇;韩晓亮;郭媛媛;张聪;刘栓平;魏闯;李永君;叶志海 | 申请(专利权)人: | 博尔诚(北京)科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;C12N15/12;C40B40/06 |
代理公司: | 北京彩和律师事务所 11688 | 代理人: | 闫桑田;刘磊 |
地址: | 100176 北京市大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 胰腺癌 标志 探针 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于检测胰腺癌的标志物,其特征在于,所述标志物为SPESP1或KIAA1328。
2.根据权利要求1所述的标志物,其特征在于,所述标志物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2,优选所述标志物为甲基化后的标志物。
3.一种探针组合物,其特征在于,所述探针组合物包含靶向甲基化后的标志物的探针;
所述标志物为权利要求1或2所述的标志物。
4.根据权利要求3所述的探针组合物,其特征在于,所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物,所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的高甲基化的区域杂交,所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的低甲基化的区域杂交;
优选的,所述第一探针组合物包括n个探针,所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的高甲基化的区域的正义链和/或反义链的每个核苷酸杂交;
优选的,所述第二探针组合物包括m个探针,所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的低甲基化的区域的正义链和/或反义链的每个核苷酸杂交;
优选的,n和m均是1-10中的任意整数;
优选的,第n-1个探针和第n个探针之间有x1个核苷酸重叠,优选的,x1为0-100中的任意整数;
优选的,第m-1个探针和第m个探针之间有x2个核苷酸重叠,优选的,x2为0-100中的任意整数;
进一步优选的,所述第一探针组合物包括如SEQ ID NO:3-6中的一种或两种,所述第二探针组合物包括如SEQ ID NO:7-10中的一种或两种。
5.标志物在制备用于检测胰腺癌的试剂盒中的用途,所述标志物为SPESP1或KIAA1328。
6.根据权利要求5所述的用途,其特征在于,所述标志物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2,优选所述标志物为甲基化后的标志物;
优选的,所述探针组合物用于靶向胰腺癌的甲基化后的标志物;
优选的,所述探针组合物为权利要求3或4所述的探针组合物。
7.一种用于胰腺癌检测的组合物,其特征在于,所述组合物包括用于检测甲基化后的SPESP1或KIAA1328的核酸。
8.根据权利要求7所述的组合物,其特征在于,所述标志物的核苷酸序列为SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2。
9.根据权利要求7或8所述的组合物,其特征在于,所述核酸包括权利要求3或4所述的探针组合物;
优选的,所述核酸包括:
引物,所述引物为所述标志物的靶序列中的至少9个核苷酸的片段,所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列;
优选的,所述核酸还包括:
探针,所述探针为在中等严紧或严紧条件下与所述标志物的靶序列中的至少15个核苷酸片段杂交,所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列;
优选的,所述组合物还包括将标志物的靶序列的5位未甲基化胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶的试剂;
优选的,所述用于检测标志物的靶序列甲基化的核酸还包括:
优先与处于非甲基化状态的靶序列结合的阻断剂。
10.一种试剂盒,其特征在于,包含用于检测权利要求1或2所述的标志物的试剂或者权利要求3或4所述的探针组合物或者权利要求7-9中任一项所述的组合物。
11.一种芯片,其特征在于,包含权利要求1或2所述的标志物或者权利要求3或4所述的探针组合物或者权利要求7或8所述的组合物。
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