[发明专利]胶质母细胞瘤预后预测评分模型及其在指导临床精准诊疗中的应用有效
申请号: | 202210051356.2 | 申请日: | 2022-01-18 |
公开(公告)号: | CN114075604B | 公开(公告)日: | 2022-04-08 |
发明(设计)人: | 康春生;崔晓腾;方川;王琦雪;檀艳丽;赵吉星 | 申请(专利权)人: | 天津医科大学总医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G16B5/00 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 朱萍 |
地址: | 300052 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胶质 细胞 预后 预测 评分 模型 及其 指导 临床 精准 诊疗 中的 应用 | ||
1.检测样本中基因群表达水平的试剂在制备用于胶质母细胞瘤预后预测产品中的应用,其特征在于,所述基因群为GFAP、CHI3L1、EGFR、PDGFA、ACSS3、ACSL3、ELOVL2组合。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术、二代测序技术中的一种或多种检测样本中所述基因群表达水平的试剂。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括检测所述基因群mRNA表达水平的试剂。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂包括检测所述基因群蛋白表达水平的试剂。
5.一种用于胶质母细胞瘤预后预测的装置,其特征在于,所述装置包括:
(1) 数据获取模块,用于获取待测胶质母细胞瘤患者样本中的基因群表达谱数据,所述基因群为GFAP、CHI3L1、EGFR、PDGFA、ACSS3、ACSL3、ELOVL2组合;
(2) 预测模块,用于将所述数据获取模块得到的基因群表达谱数据作为输入数据提供给预测模型,所述预测模型基于胶质母细胞瘤患者的基因群表达谱数据而对所述胶质母细胞瘤患者的预后进行预测;
(3) 预测结果获取模块,用于获取所述预测模块中预测模型的输出结果,得到待测胶质母细胞瘤患者的预后预测结果;
所述预测模型为Cox回归模型;
所述Cox回归模型为LASSO Cox回归模型;
所述预测模型的公式为风险评分=,其中,N为用于预测预后的基因数,Expi为每个基因的表达水平,Ci为每个基因的回归系数;当风险评分高于中位数时,患者预后不良,当风险评分低于中位数时,患者预后良好。
6.一种计算机设备,其特征在于,所述计算机设备包括存储器和处理器,所述存储器存储有程序,所述处理器执行所述程序时实现如下方法:
获取待测胶质母细胞瘤患者样本中的基因群表达谱数据,所述基因群为GFAP、CHI3L1、EGFR、PDGFA、ACSS3、ACSL3、ELOVL2组合;
将所述基因群表达谱数据作为输入数据提供给预测模型;
输出待测胶质母细胞瘤患者的预后预测结果;
所述预测模型为Cox回归模型;
所述Cox回归模型为LASSO Cox回归模型;
所述预测模型的公式为风险评分=,其中,N为用于预测预后的基因数,Expi为每个基因的表达水平,Ci为每个基因的回归系数;当风险评分高于中位数时,患者预后不良,当风险评分低于中位数时,患者预后良好。
7.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质上存储有程序,所述程序被执行时实现如下方法:
获取待测胶质母细胞瘤患者样本中的基因群表达谱数据,所述基因群为GFAP、CHI3L1、EGFR、PDGFA、ACSS3、ACSL3、ELOVL2组合;
将所述基因群表达谱数据作为输入数据提供给预测模型;
输出待测胶质母细胞瘤患者的预后预测结果;
所述预测模型为Cox回归模型;
所述Cox回归模型为LASSO Cox回归模型;
所述预测模型的公式为风险评分=,其中,N为用于预测预后的基因数,Expi为每个基因的表达水平,Ci为每个基因的回归系数;当风险评分高于中位数时,患者预后不良,当风险评分低于中位数时,患者预后良好。
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