[发明专利]维奈托克耐药性急性髓细胞性白血病的受试者特异性治疗

说明书

本公开提供了治疗维奈托克耐药性急性髓细胞性白血病的方法，其包括在否则将对使用维奈托克和/或阿扎胞苷的治疗有抗性的患者的特定子集中鉴定替代治疗靶标的方法。

相关申请

本申请要求2020年10月6日提交的美国临时申请号63/087,998的优先权和权益，其内容经此引用全文并入本文。

技术领域

本发明涉及维奈托克(venetoclax)耐药性急性髓细胞性白血病的受试者特异性治疗方面的改善。

发明背景

急性髓细胞性白血病(AML)是一种血液癌症，其中受试者的骨髓产生异常的成髓细胞、红细胞或血小板。AML是成人中最常见的急性白血病形式之一。AML细胞在骨髓和血液中的积聚可迅速导致感染、贫血、大量出血和死亡。BCL-2抑制剂维奈托克近来已经成为急性髓细胞性白血病(AML)治疗的重要组分。目前FDA批准的用于大多数过于年老或不适合积极化疗(aggressive chemotherapy)的患者的护理标准是用与诸如阿扎胞苷(azacitidine)(“Ven/aza治疗”)或地西他滨(decitabine)之类的去甲基化剂(hypomethylating agent)组合的维奈托克治疗。据估计，这些患者中的大约70％在Ven/Aza治疗后将实现其疾病的完全缓解(CR)。但是，据估计，大约30％的患者对采用ven/aza的治疗没有反应，并且不能实现CR。本领域对于鉴定将对Ven/aza治疗无反应的受试者的方法以及治疗此类受试者的方法的需求尚未得到满足。本公开解决了这种需求。

发明概述

本公开提供了鉴定将对使用维奈托克与阿扎胞苷的组合的治疗有抗性的患有急性髓细胞性白血病(AML)的受试者的方法，该方法包括：a)测量从来自该受试者的生物样品中分离的多个白血病细胞中至少10种基因的表达水平，其中至少10种基因选自PCDH9、LAMP5、PPP1R27、MPO、CTSG、RNASE1、AREG、VCAN、S100A9、S100A8、MT2A、ELANE、RNASE3、RETN、RND3、FCER1A、AGR2、FN1、MKI67、TPSB2、U2AF1、FAM83A、IFIT2、PLBD1、S100A12、PRTN3、DLK1、MT1G、THBS1、G0S2、TPSAB1、LINC00861、HPGD、C1QA、HMOX1、CCL4、SERPINB2、CCL4L2、MS4A2、DDIT4L、MT1H、FCGR3A、C1QB、CLC、MMP9、PRG2、HDC、C1QC、CCL2和CCL7；b)基于步骤(a)中测得的表达水平，将测量的细胞分类为对使用维奈托克与阿扎胞苷的组合的治疗有抗性或将测量的细胞分类为对使用维奈托克与阿扎胞苷的组合的治疗有反应；c)确定多个白血病细胞中分类为对使用维奈托克与阿扎胞苷的组合的治疗有抗性的白血病细胞的百分比；d)将来自步骤(c)的百分比与预定的截止百分比进行比较；和e)当来自步骤(c)的百分比大于预定的截止百分比时，鉴定该受试者将对使用维奈托克与阿扎胞苷的组合的治疗有抗性。