[发明专利]一种银鲳鱼物种鉴定用标准质粒分子及其应用在审
申请号: | 202111660982.3 | 申请日: | 2021-12-31 |
公开(公告)号: | CN114369611A | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
发明(设计)人: | 叶蕾;容敏靖;石磊;曹炜伟;张璜;龚晗悦 | 申请(专利权)人: | 暨南大学 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N15/53;C12Q1/6888;C12Q1/6851 |
代理公司: | 广州市深研专利事务所(普通合伙) 44229 | 代理人: | 姜若天 |
地址: | 510000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鲳鱼 物种 鉴定 标准 质粒 分子 及其 应用 | ||
1.一种银鲳鱼物种鉴定用标准质粒分子pUC-SA,其特征在于含有细胞色素氧化酶亚基I基因片段,其全碱基序列如SEQ NO.1所示。
2.一种权利要求1所述标准质粒分子pUC-SA的构建方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)设计PCR特异性引物:根据银鲳鱼细胞色素氧化酶亚基I基因片段设计PCR特异引物:
SA-1F:5'-CACGAAATCACCACCCACGA-3';
SA-1R:5'-CCTGTAAGAGGGGGGA-3';
(2)获取目的片段:利用上述PCR特异性引物扩增目的片段;
(3)质粒的构建:上述得到的PCR产物回收后,通过连接酶连接到pUC24-R载体上;连接后的产物转化至大肠杆菌DH5α建立转化感受态细胞,37℃过夜培养,菌落PCR筛选阳性克隆,采用凝胶电泳法鉴定阳性质粒并测序验证,鉴定为阳性质粒的即为于银鲳鱼特异性质粒分子pUC-SA;
所述步骤(1)中,PCR特异性引物为一对,序列如下:
SA-1F:5'-CACGAAATCACCACCCACGA-3';
SA-1R:5'- CCTGTAAGAGGGGGGA -3';
所述步骤(2)中,获取目的片段的步骤如下:扩增所用引物为 SA-1F和SA-1R,扩增体系为2×Taq Master Mix 12.5μL,10μmol/L SA-1F引物1μL,10μmol/L SA-1R引物1μL,模板DNA 1μL,加水补足至 25μL;反应程序为:95℃ 3min预变性;95℃ 15s,58℃ 15s,72℃60s,重复30个循环;72℃ 5 min。
3.权利要求1所述标准质粒分子pUC-SA的均匀性检测方法,其特征在于包括如下步骤:随机抽样法抽取20管,编号201-220,每管重复检测3次;测试顺序:第1次,201~220;第2次,220~201;第3次,单数201~219,偶数202~220,分别检测质粒的质量与质量浓度,数据通过方差分析及F检验判断管间样品均匀性。
4.权利要求1所述标准质粒分子pUC-SA的稳定性检测方法,其特征在于包括如下步骤:(1)运输稳定性:随机抽取样本分别置于-20、0、4、25、37℃条件下,放置2周;每个温度下放置4管,进行质粒电泳观察条带完整性,并进行PCR扩增评估其扩增曲线一致性;(2)储存稳定性:在-20℃条件下,于5、10、15、20和25个月各时间点随机取样4管,每管重复测试3次质量和纯度,数据通过方差分析及F检验判断储存稳定性,并将质粒进行电泳观察条带完整性,并进行PCR扩增评估其扩增曲线一致性。
5.权利要求1所述标准质粒分子pUC-SA实时荧光PCR扩增评估方法,其特征在于包括如下步骤:采用TaqMan 探针实时荧光定量PCR反应体系的配置进行检测,检测体系为:PremixEx Taq PCR Mix 12.5μL,10µmol/L引物各1μL,10µmol/L 探针 0.5µL,质粒分子pUC-SA 2μL,加去离子水补足至 25μL;使用ABI 7500荧光定量PCR仪或QuantStudio™ 6 Flex进行扩增反应,反应程序如下:95℃反应10min;95℃反应15s,60℃反应 60s,45个循环,每循环延伸结束时收集荧光信号。
6.权利要求1所述标准质粒分子pUC-SA在定性检测银鲳鱼物种中的应用。
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