[发明专利]分子对接的处理方法、装置及电子设备

权利要求书

1.一种分子对接的处理方法，其特征在于，包括：

分别获取模板分子和待对接分子的分子骨架，其中，所述模板分子的分子骨架具有对应的已知原子三维坐标；

将所述模板分子及各所述待对接分子的分子骨架按照预设分组规则进行分组，先将模板分子和一待对接分子的分子骨架形成骨架相似的分子对，其中，所述分子对包含一个第一分子骨架和一个第二分子骨架；再循环将所述模板分子或对接后分子的第一分子骨架与剩余待对接分子的第二分子骨架组成骨架相似的分子对，其中，所述第一分子骨架为所述模板分子或已获得原子三维坐标的待对接分子的分子骨架，所述第二分子骨架为未获得原子三维坐标的待对接分子的分子骨架；

按照对应的预设分子对接方法，分别将所述第二分子骨架参照对应的分子对中的第一分子骨架的原子三维坐标与受体蛋白进行对接，获得所述第二分子骨架的原子三维坐标，以将所述分子对中的所述第二分子骨架切换为对应的第一分子骨架；

分别根据所述第一分子骨架的原子三维坐标，获得各所述待对接分子对应的对接后分子的构象信息。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述分别获取模板分子和待对接分子的分子骨架，包括：

分别获取模板分子和待对接分子的分子结构信息；

去掉所述模板分子和待对接分子的分子结构信息中的氢原子及隐藏所述分子结构信息中的重原子的元素信息，获得所述模板分子和待对接分子的分子骨架。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述将所述模板分子及各所述待对接分子的分子骨架按照预设分组规则进行分组，先将模板分子和一待对接分子的分子骨架形成骨架相似的分子对，其中，所述分子对包含一个第一分子骨架和一个第二分子骨架再循环将所述模板分子或对接后分子的第一分子骨架与剩余待对接分子的第二分子骨架组成骨架相似的分子对，包括：

根据预设特征，分别获取所述模板分子和每一待对接分子的分子骨架之间对应的特征分值，以及获取每两个不同的待对接分子的分子骨架之间对应的特征分值；

根据各所述特征分值的数值大小，将所述模板分子的分子骨架和各待对接分子的第二分子骨架之间特征分值最大的一组分子骨架配对形成分子对之后，分别将所述模板分子或对接后分子的第一分子骨架与剩余待对接分子的第二分子骨架之间特征分值最大的一组分子骨架配对形成分子对。

4.根据权利要求1-3任一所述的方法，其特征在于，所述将所述模板分子及各所述待对接分子的分子骨架按照预设分组规则进行分组，形成多组分子对之后，还包括：

将每一所述分子对中的第一分子骨架和第二分子骨架进行结构匹配，确定所述第二分子骨架在与所述第一分子骨架的最大公共子结构之外是否含有可旋转二面角；

当所述第二分子骨架在所述最大公共子结构外含有可旋转二面角，则结合所述受体蛋白的结构对所述可旋转二面角进行优化；

当所述第二分子骨架在所述最大公共子结构外不含有可旋转二面角，则将所述分子对中的所述第二分子骨架向所述第一分子骨架叠合。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述按照对应的预设分子对接方法，分别将所述第二分子骨架参照对应的分子对中的第一分子骨架的原子三维坐标与受体蛋白进行对接，获得所述第二分子骨架的原子三维坐标，包括：

当所述第二分子骨架在最大公共子结构外不含有可旋转二面角，获取所述分子对中的第一分子骨架和第二分子骨架在最大公共子结构上的各原子映射关系；

针对每一所述原子映射关系，分别根据第一分子骨架中的原子三维坐标获得第二分子骨架在最大公共子结构中对应的原子的三维坐标，及根据预设函数获得第二分子骨架在所述最大公共子结构以外的重原子的三维坐标。