[发明专利]测定单细胞亚群的基因表达的方法及相关试剂盒和应用在审
申请号: | 202111549870.0 | 申请日: | 2021-12-17 |
公开(公告)号: | CN116334204A | 公开(公告)日: | 2023-06-27 |
发明(设计)人: | 黄丹;梁广锡;邓亮生 | 申请(专利权)人: | 细胞图谱有限公司;香港中文大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;洪欣 |
地址: | 中国香港新界沙田*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 测定 单细胞 基因 表达 方法 相关 试剂盒 应用 | ||
1.外周血样本分析方法,其包括测定外周血样本中的单细胞亚群靶基因的转录本丰度和单细胞亚群参考基因的转录本丰度,其中所述单细胞亚群靶基因选自表2-2中示出的至少一种,所述单细胞亚群参考基因选自PSAP或CTSS,优选地,所述单细胞亚群为单核细胞。
2.用于测定基因转录本丰度的试剂成分在制备用于外周血样本分析方法的试剂盒中的用途,其中所述方法包括测定外周血样本中的单细胞亚群靶基因的转录本丰度和单细胞亚群参考基因的转录本丰度,其中所述单细胞亚群靶基因选自表2-2中示出的至少一种,所述单细胞亚群参考基因选自PSAP或CTSS,优选地,所述单细胞亚群为单核细胞。
3.根据权利要求1所述的方法或权利要求2所述的用途,其中所述单细胞亚群靶基因选自以下的一种或多种:VNN1、CYP1B1、NLRC4、PFKFB3、LILRA5、NFKBIZ、CALHM6、WARS1、ATF3、IFITM3、IFI44L和IFI30。
4.根据权利要求1所述的方法或权利要求2所述的用途,其中所述方法包括如下步骤:
a).获得外周血样本;
b).测定所述外周血样本的单细胞亚群靶基因的转录本丰度,以获得第一量;
c).测定所述外周血样本的单细胞亚群参考基因的转录本丰度,以获得第二量;
d).计算生物标志物参数,所述参数为所述第一量与所述第二量的相对值,任选地所述方法还包括将所述相对值与临界值进行比较。
5.试剂盒,其包含用于定量基因转录本丰度的试剂成分,所述基因选自表2-2中示出的一种或多种靶基因,以及表2-1中示出的一种或多种参考基因。
6.用于定量基因转录本丰度的试剂成分在制备用于对体温异常患者进行鉴别和分流的试剂盒或药物中的应用,其中所述基因选自表2-2中示出的一种或多种靶基因,以及表2-1中示出的一种或多种参考基因。
7.根据权利要求5所述的试剂盒或权利要求6所述的应用,其中所述靶基因是:选自以下第(1)组基因的至少一种和选自以下第(2)组基因的至少一种的基因组合,选自以下第(1)组基因的至少一种和选自以下第(3)组基因的至少一种的基因组合,选自以下第(2)组基因的至少一种和选自以下第(3)组基因的至少一种的基因组合,或者选自以下第(1)组基因的至少一种、选自以下第(2)组基因的至少一种和选自以下第(3)组基因的至少一种的基因组合:
(1)VNN1、CYP1B1、NLRC4、PFKFB3、LILRA5、NFKBIA、NFKBIZ和NAIP;
(2)CALHM6、WARS1、GADD45B、NR4A1、SGK1、ATF3和TCN2;
(3)IFITM3、IFI44L和IFI30;
优选地,所述靶基因为VNN1和CALHM6的组合,或者所述靶基因为VNN1、WARS1和IFI44L的组合。
8.根据权利要求6或7所述的应用,其中所述体温异常患者为发热患者,优选地,所述体温异常患者为细菌感染患者、病毒感染患者、肺结核患者或自身免疫疾病患者,更优选地,所述病毒感染患者为流感病毒感染患者,所述肺结核患者为活动性肺结核患者,所述自身免疫疾病患者为系统性红斑狼疮患者。
9.根据权利要求7或8所述的应用,其中所述第(1)组基因中的一种或多种基因用于鉴别细菌感染患者,所述第(2)组基因中的一种或多种基因用于鉴别肺结核患者,特别是活动性肺结核患者,和/或所述第(3)组基因中的一种或多种基因用于鉴别病毒感染患者或自身免疫疾病患者。
10.根据权利要求7或8所述的应用,其中所述体温异常患者为发热患者,优选地,所述体温异常患者为川崎病患者,其中利用所述第(1)组基因中的一种或多种基因来鉴别川崎病患者。
11.根据权利要求5所述的试剂盒或权利要求6所述的应用,其中所述试剂成分包括引物,所述引物的序列如SEQ ID NOs:1-8任一项所示;以及优选地,所述基因获自外周血样本,更优选获自所述外周血样本的单核细胞。
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