[发明专利]一种同时检测六种水稻病毒的试剂盒及其应用在审
申请号: | 202111483040.2 | 申请日: | 2021-12-07 |
公开(公告)号: | CN114410833A | 公开(公告)日: | 2022-04-29 |
发明(设计)人: | 黄静;吴建国 | 申请(专利权)人: | 漳州职业技术学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 泉州市潭思专利代理事务所(普通合伙) 35221 | 代理人: | 何碧明 |
地址: | 363000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 水稻 病毒 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种同时检测六种水稻病毒的试剂盒,其特征在于:包括:用于检测水稻锯齿叶矮缩病毒RRSV的引物组、用于检测水稻条纹病毒RSV的引物组、用于检测水稻矮缩病毒RDV的引物组、用于检测南方水稻黑条矮缩病毒SRBSDV的引物组、用于检测水稻黑条矮缩病毒RBSDV的引物组、用于检测水稻草状矮化病毒RGSV的引物组;
所述用于检测水稻锯齿叶矮缩病毒RRSV的引物组如下:
RRSV CP(p8)-F CGGAGAGAGATAACGCTTGG
RRSV CP(p8)-R CACAGTAATAACCGCACGCT;
所述用于检测水稻条纹病毒RSV的引物组如下:
RSV CP(pC3)-F GGCTGTGGACTCTTCTGACC
RSV CP(pC3)-R TTGTCAGACCACGCTCCTTC;
所述用于检测水稻矮缩病毒RDV的引物组如下:
RDV CP(p8)-F TGTATGAGCGCCAAAATGCG
RDV CP(p8)-R CCACCACCAAGTGAGAACGA;
所述用于检测南方水稻黑条矮缩病毒SRBSDV的引物组如下:
SRBSDV CP(p10)-F CACACTTCTGTCTCACTTCAACTCTCT
SRBSDV CP(p10)-R CTTACGCAACGATGAACCTTTCTCTAT;
所述用于检测水稻黑条矮缩病毒RBSDV的引物组如下:
RBSDV CP(p10)-F GAAGGAAACATTACTTTGAAGCCC
RBSDV CP(p10)-R CGCTCAACACTTCGCCAAT;
所述用于检测水稻草状矮化病毒RGSV的引物组如下:
RGSV CP(pC5)-F ATTGAGACCCATTAGTACCGTTG
RGSV CP(pC5)-R AGAGCAGTTTCCTGTAGTCCCCA。
2.根据权利要求1所述的同时检测六种水稻病毒的试剂盒,其特征在于:还包括:Onestep RT/Taq Mix、5×Reaction Buffer和DEPC-ddH2O。
3.权利要求1所述的试剂盒在检测水稻病毒中的应用。
4.采用权利要求1所述的试剂盒检测水稻病毒的方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤1,提取水稻叶片总RNA;
步骤2,以步骤1提取的水稻叶片总RNA为模板,采用权利要求1所述的试剂盒对其进行RT-PCR扩增;
步骤3,对步骤2的PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测;
结果判断标准如下:在100~250bp之间出现条带则存在水稻条纹病毒RSV;在250~500bp之间,接近250bp出现条带则存在水稻草状矮化病毒RGSV,接近500bp左右出现条带则存在水稻矮缩病毒RDV;在500~750bp之间出现条带则存在水稻锯齿叶矮缩病毒RRSV;靠近750bp出现条带则存在水稻黑条矮缩病毒;靠近1000bp出现条带则存在南方水稻黑条矮缩病毒SRBSDV。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤2中的RT-PCR扩增体系包括:OnestepRT/Taq Mix 0.75μL、5×Reaction Buffer 4μL,模板量为1μg,0.3μM RSV引物0.6μL,0.2μMRDV引物0.4μL,0.25μM RGSV引物0.3μL,0.2μM RRSV引物0.4μL,0.3μM RBSDV引物0.6μL,0.1μM SRBSDV引物0.2μL,DEPC-ddH2O补足至20μL。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:步骤2中RT-PCR扩增条件为:
反转录反应条件:50℃,30min;
RT-PCR反应条件:预变性,94℃,2min;变性,94℃,30s;退火,58℃,30s;延伸,72℃,1min;重复变性、退火和延伸30个循环;终延伸,72℃,10min。
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