[发明专利]预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的标志物组合及其应用

说明书

本发明提出了一种预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物组合及其应用，该标志物组合所述标志物组合包含HLA‑B62超型中的至少之一。根据本发明实施例的标志物组合可以对对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂的治疗疗效进行准确预测，如PD‑1/PD‑L1抑制剂单用，或与CTLA‑4抑制剂联用，提高胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗的响应率。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，具体地，涉及预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的标志物组合及其应用，更具体地，涉及预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物组合、所述标志物组合在预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效中的用途、计算机可读存储介质、用于预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的电子设备、一种预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的方法、一种预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的系统、一种用于预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的试剂盒。

背景技术

胃肠道肿瘤是一系列消化道恶性肿瘤的统称，包括胃癌，食管癌，结直肠癌等。在我国每年癌症新发病例和死亡病例中，胃癌，食管癌和结直肠癌这三种最常见的胃肠道癌症统计病例数均高居前十，对人民群众的生命健康构成严重威胁。近年来，靶向PD-1/PD-L1及CTLA-4的免疫检查点抑制剂(ICB)为广大癌症患者带来了显著的生存获益。然而，免疫检查点阻断(ICB)治疗的一大缺陷是其治疗响应率在大多数癌种里普遍较低(10-30％)，很多接受免疫检查点抑制剂治疗的患者并不能从中受益。因此，开发探索与免疫检查点抑制剂疗效预测相关的生物标志物是目前肿瘤免疫治疗中一个显著的未满足的临床需求。

已有许多研究揭示了PD-L1表达，肿瘤突变负荷(TMB)，微卫星不稳定性(MSI)，肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)，基因表达谱(GEP)以及某些驱动突变与癌症患者对PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂治疗响应性之间的关系。遗憾的是，上述生物标志物适用于非小细胞肺癌或黑色素瘤，而在胃肠道癌症中可用于预测患者接受免疫检查点抑制剂治疗响应或耐药的标志物还知之甚少，亟需有效的预测性标志物以助力胃肠道癌症患者的免疫治疗临床决策。

发明内容

本申请是基于发明人对以下问题的发现和认识作出的：

已有研究揭示了微卫星不稳定性(MSI)、肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)、基因表达谱(GEP)以及某些驱动突变与癌症患者对PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂治疗响应性之间具有一定的联系。发明人经过大量的实验探索，发现B62超型、肿瘤突变负荷(TMB)或TP53基因的突变可以用来预测对象肿瘤免疫检查点抑制剂的治疗疗效，从而提高胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗的响应率。

因此，在本发明的第一方面，本发明提出了一种预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物组合。根据本发明的实施例，所述标志物组合包含HLA-B62超型中的至少之一。根据本发明实施例的标志物组合可以有效预测所述对象肿瘤免疫检查点抑制剂的治疗疗效，从而提高胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗的响应率。

根据本发明的实施例，上述标志物组合还可以进一步包括如下附加技术特征至少之一：

根据本发明的实施例，所述HLA-B62超型包括：B*1501、B*1502、B*1505、B*1512、B*1513、B*1514、B*1515、B*1519、B*1520、B*1525、B*1528、B*1530、B*1531、B*1533、B*1534、B*1538、B*1539、B*1540、B*1548、B*1550、B*1560、B*1563、B*1565、B*1570、B*1575、B*1578、B*1581、B*1582、B*1583、B*1585、B*1588、B*1592、B*1596、B*1597、B*3528、B*4021、B*4601、B*4603、B*4604、B*4605、B*5201、B*5202、B*5203、B*5204、B*5205、B*5207、B*5208、B*7805、B*9502、B*9504。

根据本发明的实施例，进一步包括体细胞基因。