[发明专利]预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的标志物组合及其应用在审
申请号: | 202111466674.7 | 申请日: | 2021-12-03 |
公开(公告)号: | CN114231628A | 公开(公告)日: | 2022-03-25 |
发明(设计)人: | 张恒辉;沈琳;张磊;鲁智豪;杨滢;李健;孙怀博;张小田;杜波;彭智 | 申请(专利权)人: | 无锡臻和生物科技有限公司;北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院) |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G16B20/20 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵丽婷 |
地址: | 214104 江苏省无锡市锡山区安镇*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 预测 胃肠 肿瘤 免疫 检查点 抑制剂 疗效 标志 组合 及其 应用 | ||
1.一种预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物组合,其特征在于,所述标志物组合包含HLA-B62超型中的至少之一。
2.根据权利要求1所述的标志物组合,其特征在于,所述HLA-B62超型包括:B*1501、B*1502、B*1505、B*1512、B*1513、B*1514、B*1515、B*1519、B*1520、B*1525、B*1528、B*1530、B*1531、B*1533、B*1534、B*1538、B*1539、B*1540、B*1548、B*1550、B*1560、B*1563、B*1565、B*1570、B*1575、B*1578、B*1581、B*1582、B*1583、B*1585、B*1588、B*1592、B*1596、B*1597、B*3528、B*4021、B*4601、B*4603、B*4604、B*4605、B*5201、B*5202、B*5203、B*5204、B*5205、B*5207、B*5208、B*7805、B*9502、B*9504。
3.根据权利要求1所述的标志物组合,其特征在于,进一步包括体细胞基因;
任选地,进一步包括TP53基因。
4.根据权利要求3所述的标志物组合,其特征在于,所述体细胞基因包括:体细胞基因组编码区基因。
5.根据权利要求1所述的标志物组合,其特征在于,所述免疫检查点抑制剂为PD-1/PD-L1抑制剂和/或CTLA-4抑制剂。
6.根据权利要求1所述的标志物组合,其特征在于,所述对象包括不患胃肠肿瘤的个体或患胃肠肿瘤个体。
7.根据权利要求1所述的标志物组合,其特征在于,所述胃肠肿瘤为胃癌、食管鳞癌、结肠癌或直肠癌中的至少之一。
8.权利要求1-7任一项所述标志物组合在预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效中的用途。
9.根据权利要求8所述的用途,其特征在于,依据所述对象是否含有HLA-B62超型判断所述对象免疫检查点抑制剂治疗是否有效。
10.根据权利要求8所述的用途,其特征在于,进一步依据所述对象肿瘤突变负荷或是否含有所述TP53突变型基因判断所述对象免疫检查点抑制剂治疗是否有效;
任选地,所述肿瘤突变负荷是基于所述体细胞基因突变数目获得的;
任选地,所述肿瘤突变负荷为体细胞基因突变数目与所述体细胞基因大小的比值。
11.根据权利要求8所述的用途,其特征在于,所述对象不含有所述HLA-B62超型是所述对象免疫检查点抑制剂治疗有效的指示。
12.根据权利要求8所述的用途,其特征在于,所述对象不含有所述HLA-B62超型,且肿瘤突变负荷7.2/Mb是所述对象免疫检查点抑制剂治疗有效的指示。
13.根据权利要求8所述的用途,其特征在于,所述对象不含有所述HLA-B62超型、不含有TP53突变型基因是所述对象免疫检查点抑制剂治疗有效的指示;
任选地,所述TP53突变型基因不包括TP53野生型基因经融合、重排或拷贝数变异的突变方式获得的基因。
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