[发明专利]一种恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合及其应用在审
| 申请号: | 202111287242.X | 申请日: | 2021-11-02 |
| 公开(公告)号: | CN113943834A | 公开(公告)日: | 2022-01-18 |
| 发明(设计)人: | 习杨;刘晏霖;楼敬伟 | 申请(专利权)人: | 上海宝藤生物医药科技股份有限公司;上海宝藤医学检验所有限公司;上海张江医学创新研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 王艳斋 |
| 地址: | 201203 上海市浦东新区中国*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 恒温 扩增 快速 核酸 检测 新型 冠状病毒 2019 ncov 引物 探针 组合 及其 应用 | ||
1.一种恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合,其特征在于,所述恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合包括特异性扩增并检测2019-nCoV的ORF1ab基因和核壳蛋白N基因的特异性引物对和探针;
所述探针的结构包括从5’端到3’端顺次连接的5’端序列、荧光发生基团、四氢呋喃、间隔序列、荧光淬灭基团、3’端序列和C3阻断基团。
2.根据权利要求1所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合,其特征在于,所述5’端序列的长度为不少于30bp;
优选地,所述荧光发生基团包括FAM、ROX或CY5中的任意一种;
优选地,所述间隔序列的长度为2~5bp;
优选地,所述荧光淬灭基团包括BHQ1或BHQ2中的任意一种;
优选地,所述3’端序列的长度为不少于13bp。
3.根据权利要求1或2所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合,其特征在于,检测所述ORF1ab基因的探针的荧光发生基团包括FAM,荧光淬灭基团包括BHQ1;
优选地,检测所述核壳蛋白N基因的探针的荧光发生基团包括ROX,荧光淬灭基团包括BHQ2。
4.根据权利要求1~3任一项所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合,其特征在于,扩增所述ORF1ab基因的特异性引物对包括SEQ ID No.1~2所示的核苷酸序列,检测所述ORF1ab基因的探针包括SEQ ID No.3所示的核苷酸序列;
优选地,扩增所述核壳蛋白N基因的特异性引物对包括SEQ ID No.4~5所示的核苷酸序列,检测所述核壳蛋白N基因的探针包括SEQ ID No.6所示的核苷酸序列。
5.根据权利要求1~4任一项所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合,其特征在于,所述恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合还包括特异性扩增并检测内标基因GAPDH的特异性引物对和探针;
优选地,检测所述内标基因GAPDH的探针的荧光发生基团包括CY5,荧光淬灭基团包括BHQ2;
优选地,扩增所述内标基因GAPDH的特异性引物对包括SEQ ID No.7~8所示的核苷酸序列,检测所述内标基因GAPDH的探针包括SEQ ID No.9所示的核苷酸序列。
6.一种恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的试剂盒,其特征在于,所述恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的试剂盒包括权利要求1~5任一项所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合;
优选地,所述恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的试剂盒还包括缓冲液、酶混合物、激活剂、阳性对照和阴性对照;
优选地,所述恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的引物探针组合制成引物探针混合液;
优选地,所述酶混合物包括结合单链核酸的重组酶、单链DNA结合蛋白、链置换DNA聚合酶和解旋酶;
优选地,所述引物探针混合液、酶混合物和缓冲液制成预混液;
优选地,所述预混液中,引物探针混合液、酶混合物和缓冲液的体积比为1:(1~2):(3~5),优选为3:5:11。
7.权利要求6所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的试剂盒以非疾病诊断和/或治疗为目的的使用方法,其特征在于,所述使用方法包括:
提取样本的RNA,使用权利要求6所述的恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019-nCoV的试剂盒进行RPA恒温扩增,根据检测反应的Ct值进行判断。
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