[发明专利]苏氏圆腹鲶抗病性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了苏氏圆腹鲶抗病性状相关的SNP分子标记及其应用。本发明在苏氏圆腹鲶的补体C4基因上发现了与其抗病性相关的SNP分子标记位点，所述位点与苏氏圆腹鲶的抗病性显著相关，因而可将其运用到苏氏圆腹鲶的分子标记辅助选育中，为苏氏圆腹鲶的品种培育提供了有效的遗传标记，加速了育种进程。

技术领域

本发明属于鱼类分子标记辅助育种选育技术领域。更具体地，涉及苏氏圆腹鲶抗病性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

由嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染引起的细菌性败血症，可导致鱼体全身各部位充血，出现溃疡、肠道出血、肝脏发白、腹腔积水以及溃烂等症状，且一旦发病，很难用药物来进行控制和治疗，最终导致鱼类大量死亡，严重影响鱼类养殖业的发展。因此，筛选与鱼类抗嗜水气单胞菌相关的分子标记，对鱼类进行抗病选择育种具有重要意义。

例如，沈玉帮在对草鱼补体C6和C7基因与细菌性败血症的关联分析中发现，C6基因上的单倍型GCCC与细菌性败血症易感性显著相关(沈玉帮.草鱼4个补体基因克隆表达和连锁及与细菌性败血症的关联分析[D].上海海洋大学,2013.)，为草鱼抗病品种的选育提供了支持。

苏氏圆腹鲶(Pangasianodon hypophthalmus)又名巴沙鱼，具有生长快、耐低氧、无肌间小刺等特点，是东南亚国家重要的淡水养殖品种，在我国的养殖规模也日渐扩大。然而，随着养殖集约化程度的提高，近亲繁殖导致的经济性状退化，鱼药的滥用以及养殖环境的恶化等，使得嗜水气单胞菌等对苏氏圆腹鲶养殖过程中的危害越来越严重。因此，亟需寻找与苏氏圆腹鲶抗病性状相关的分子标记，进行抗病选择育种。

发明内容

本发明要解决的技术问题是克服现有上述技术的缺陷和不足，提供一种与苏氏圆腹鲶抗病性状相关的SNP分子标记及其应用。

本发明的第一个目的是提供一种与苏氏圆腹鲶生长性状相关的SNP分子标记。

本发明的第二个目的是提供所述SNP分子标记在苏氏圆腹鲶分子标记辅助选育中的应用。

本发明的第三个目的是提供一种用于检测所述SNP分子标记的引物。

本发明的第四个目的是提供所述SNP分子标记的检测试剂盒。

本发明上述目的通过以下技术方案实现：

本发明通过直接测序法对苏氏圆腹鲶的补体C4基因进行了单核苷酸多态性(SNP)检测，通过分析不同基因型与苏氏圆腹鲶抗病性状的相关性，最终筛选出了可作为苏氏圆腹鲶分子辅助育种的SNP，为辅助苏氏圆腹鲶的分子育种提供科学依据。

本发明提供了一种与苏氏圆腹鲶抗病性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO.1所示。

具体地，SEQ ID NO.1所示序列的第288位为SNP位点：SNP1 CT。

具体地，SEQ ID NO.1所示序列的第269位为SNP位点：SNP2 AT。

具体地，SNP1为T的苏氏圆腹鲶的抗病性显著高于为C的个体。

具体地，SNP2为A时苏氏圆腹鲶的抗病性显著高于为T的个体。

具体地，SNP2为AA基因型的苏氏圆腹鲶的抗病性显著高于AT或TT基因型个体。

具体地，所述抗病性状为抗细菌性败血症性状。

本发明在苏氏圆腹鲶的补体C4基因上发现了与其抗病性相关的SNP分子标记位点，所述位点与苏氏圆腹鲶的抗细菌性败血症性状显著相关，因而可将其运用到苏氏圆腹鲶的分子标记辅助选育中。因此，本发明申请保护上述SNP分子标记在苏氏圆腹鲶分子标记辅助选育中的应用。