[发明专利]R环的高通量检测方法在审
申请号: | 202111076403.0 | 申请日: | 2021-09-14 |
公开(公告)号: | CN113832221A | 公开(公告)日: | 2021-12-24 |
发明(设计)人: | 宋东亮;王嫚;侯策;江翱;陈晶晶;刘倩;卢瑶;曹振 | 申请(专利权)人: | 翌圣生物科技(上海)股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 苏州根号专利代理事务所(普通合伙) 32276 | 代理人: | 朱华庆 |
地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通量 检测 方法 | ||
1.一种R环的高通量检测方法,其特征在于其步骤包括:
(1)提取样本中的DNA,使用ddNTP封闭样本中DNA的游离3’-OH;
(2)使用核糖核酸酶H及DNA聚合酶,将样本中RNA转化成带生物素修饰的DNA;
(3)DNA片段化和末端修复;
(4)接头连接;
(5)链霉亲和素磁珠富集带生物素修饰的DNA;
(6)链特异性文库扩增及测序。
2.根据权利要求1所述的R环的高通量检测方法,其特征在于:步骤(2)中采用大肠杆菌DNA聚合酶I以及核糖核酸酶H。
3.根据权利要求1所述的R环的高通量检测方法,其特征为:步骤(2)中对样本中的RNA扩增时使用生物素标记的dUTP。
4.根据权利要求3所述的R环的高通量检测方法,其特征为:所述生物素标记的dUTP为biotin-11-dUTP或biotin-16-dUTP。
5.根据权利要求4所述的R环的高通量检测方法,其特征为:步骤(2)的反应体系为:
组分 用量 经步骤(1)处理的样本DNA 20 ul 10 mM dA/G/CTP mix 0.2-1 ul 10 mM biotin-11-dUTP或biotin-16-dUTP 0.2-1 ul 10 U/ul E. coli DNA Polymerase I 0.5-2 ul 5 U/ul RNase H 0.1-2 ul 10× NEB Buffer™ 2 5 ul 10 mM ATP mix 1 ul 补DEPC水至 50 ul
。
6.根据权利要求5所述的R环的高通量检测方法,其特征为:步骤(2)的反应过程为16℃反应20-60 min。
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