[发明专利]R环的高通量检测方法在审

专利信息
申请号: 202111076403.0 申请日: 2021-09-14
公开(公告)号: CN113832221A 公开(公告)日: 2021-12-24
发明(设计)人: 宋东亮;王嫚;侯策;江翱;陈晶晶;刘倩;卢瑶;曹振 申请(专利权)人: 翌圣生物科技(上海)股份有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 苏州根号专利代理事务所(普通合伙) 32276 代理人: 朱华庆
地址: 200120 上海市浦*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 通量 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种R环的高通量检测方法,其特征在于其步骤包括:

(1)提取样本中的DNA,使用ddNTP封闭样本中DNA的游离3’-OH;

(2)使用核糖核酸酶H及DNA聚合酶,将样本中RNA转化成带生物素修饰的DNA;

(3)DNA片段化和末端修复;

(4)接头连接;

(5)链霉亲和素磁珠富集带生物素修饰的DNA;

(6)链特异性文库扩增及测序。

2.根据权利要求1所述的R环的高通量检测方法,其特征在于:步骤(2)中采用大肠杆菌DNA聚合酶I以及核糖核酸酶H。

3.根据权利要求1所述的R环的高通量检测方法,其特征为:步骤(2)中对样本中的RNA扩增时使用生物素标记的dUTP。

4.根据权利要求3所述的R环的高通量检测方法,其特征为:所述生物素标记的dUTP为biotin-11-dUTP或biotin-16-dUTP。

5.根据权利要求4所述的R环的高通量检测方法,其特征为:步骤(2)的反应体系为:

组分用量
经步骤(1)处理的样本DNA20 ul
10 mM dA/G/CTP mix0.2-1 ul
10 mM biotin-11-dUTP或biotin-16-dUTP0.2-1 ul
10 U/ul E. coli DNA Polymerase I0.5-2 ul
5 U/ul RNase H0.1-2 ul
10× NEB Buffer™ 25 ul
10 mM ATP mix1 ul
补DEPC水至50 ul

6.根据权利要求5所述的R环的高通量检测方法,其特征为:步骤(2)的反应过程为16℃反应20-60 min。

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