[发明专利]鉴定杏果皮毛性状的SNP标记、引物及应用有效

专利信息
申请号: 202111044010.1 申请日: 2021-09-07
公开(公告)号: CN113684301B 公开(公告)日: 2023-08-29
发明(设计)人: 张美玲;姜凤超;孙浩元;杨丽;张俊环;王玉柱 申请(专利权)人: 北京市林业果树科学研究院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 黄爽
地址: 100093 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 鉴定 果皮 性状 snp 标记 引物 应用
【权利要求书】:

1.一种鉴定杏果皮毛性状的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记序列如SEQ ID NO:1所示,其中该序列第225bp处的碱基为G或C;

所述SNP标记包含的多态性位点的基因型为GG或GC,对应的杏果实表皮有毛,若基因型为CC,对应的杏果实表皮无毛。

2.一种鉴定杏果实表皮有毛或无毛性状的方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)提取待测杏叶片的总DNA;

2)以DNA为模板,利用SEQ ID NO:2-3所示的引物进行PCR扩增;

3)分析PCR扩增产物:对扩增产物进行测序,根据测序结果判定如下:若权利要求1所述的SNP标记包含的多态性位点的基因型为GG或GC,判定为果实表皮有毛的杏,若基因型为CC,则为果实表皮无毛的杏。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,PCR反应体系为:KOD FX反应缓冲液25 µl,2mM dNTPs 10 µl,10 pmol/µl上、下游引物各1 µl,DNA模板1 µl,1.0 U/µl KOD FX 1 µl,ddH2O补齐至总体积50 µl;

PCR反应程序为:94℃ 2min;98℃ 30s,50℃ 30s,68℃ 30s,共33~37个循环;68℃ 7min;或者,

PCR反应体系为:KOD FX反应缓冲液10 µl,10 pmol/µl上、下游引物各1 µl,DNA模板1µl,ddH2O补齐至总体积20 µl;

PCR反应程序为:94℃ 2-5min;94℃ 30s,50℃ 30s,72℃ 30s,共33~37个循环;72℃10 min。

4.权利要求1所述SNP标记的以下任一应用:

(1)用于杏种质资源果实表皮有毛或无毛性状的鉴定及改良;

(2)用于杏果实表皮有毛或无毛杏的早期预测;

(3)用于杏果实表皮有毛或无毛杏的分子标记辅助育种。

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